基因页：GBP1

概括?
基因ID 2633
Symbol GBP1
同义词 -
描述 guanylate binding protein 1
参考 MIM:600411|HGNC:HGNC:4182|Ensembl:ENSG00000117228|HPRD:02681|Vega:OTTHUMG00000010614
基因type protein-coding
地图位置 1p22.2
Pascal P值 0.997
Fetal beta -2.493
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 Co-occurance与Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS12041093 chr1 58462509 GBP1 2633 0.05 trans
RS12023109 chr1 58482942 GBP1 2633 0.05 trans
rs473019 chr1 72296394 GBP1 2633 0.13 trans
rs1342707 chr1 147264296 GBP1 2633 2.765E-8 trans
rs4496377 chr2 18229254 GBP1 2633 0.2 trans
rs17042744 chr2 21824821 GBP1 2633 0 trans
RS918897 chr2 21825859 GBP1 2633 0.19 trans
RS2113625 chr2 21828617 GBP1 2633 0 trans
RS17680142 chr2 21849670 GBP1 2633 0 trans
rs6547745 chr2 21852551 GBP1 2633 0 trans
rs6758775 chr2 21887142 GBP1 2633 0.15 trans
rs17042868 chr2 21895688 GBP1 2633 0 trans
rs11893111 chr2 21910980 GBP1 2633 0 trans
rs7617502 chr3 3110335 GBP1 2633 0.08 trans
rs529098 chr3 54677190 GBP1 2633 0.12 trans
RS16847252 chr3 163481290 GBP1 2633 0.17 trans
rs10050133 chr4 30447171 GBP1 2633 0.15 trans
rs17576136 chr4 37384794 GBP1 2633 0.07 trans
RS10515260 chr5 97076547 GBP1 2633 1.339E-5 trans
RS6920921 chr6 8884160 GBP1 2633 0.04 trans
RS2327748 chr6 14082533 GBP1 2633 0.01 trans
rs16869716 chr6 71743471 GBP1 2633 2.935E-5 trans
rs4895829 chr6 128379092 GBP1 2633 0.08 trans
RS4897243 chr6 128389073 GBP1 2633 0.14 trans
rs12672637 chr7 88556834 GBP1 2633 0.05 trans
RS7790094 chr7 152786528 GBP1 2633 0.13 trans
RS9325708 chr8 12402940 GBP1 2633 0 trans
RS3802522 chr10 28341865 GBP1 2633 0 trans
RS10508730 chr10 28403391 GBP1 2633 0 trans
rs2489013 chr10 102391739 GBP1 2633 0.1 trans
rs7089703 chr10 119182182 GBP1 2633 0.15 trans
rs7078328 chr10 124029258 GBP1 2633 0.01 trans
rs10510107 chr10 124029470 GBP1 2633 0 trans
rs4237539 chr10 124065659 GBP1 2633 0.15 trans
rs4317918 chr10 124065869 GBP1 2633 0.15 trans
RS10887122 chr10 124071344 GBP1 2633 0.15 trans
rs10743139 chr11 10425326 GBP1 2633 0.05 trans
rs4303487 chr16 90033254 GBP1 2633 0.01 trans
rs9619990 chr22 42163258 GBP1 2633 0.05 trans
rs8141783 chr22 42179110 GBP1 2633 0.12 trans
rs17342476 chrX 102243644 GBP1 2633 0.02 trans
rs17342483 chrX 102250155 GBP1 2633 0.04 trans
rs17342504 chrX 102272107 GBP1 2633 0.02 trans
SNP_A-2138851 0 GBP1 2633 0.02 trans
SNP_A-2059928 0 GBP1 2633 0.02 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
ZNF236 0.70 0.75
GOLGA3 0.69 0.74
UBN1 0.69 0.74
DIP2A 0.69 0.72
MTF1 0.69 0.73
TSC1 0.69 0.74
DHX33 0.69 0.73
ZFYVE20 0.68 0.73
SNX27 0.68 0.74
KIAA1409 0.68 0.72
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AF347015.21 -0.56 -0.62
RHOC -0.52 -0.62
AF347015.31 -0.51 -0.55
VAMP5 -0.51 -0.59
higd1b -0.51 -0.56
IFI27 -0.50 -0.55
GNG11 -0.50 -0.55
C1orf54 -0.50 -0.63
MT-CO2 -0.50 -0.53
METRN -0.49 -0.55

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
Reactome干扰素伽马信号传导 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON SIGNALING 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROY WOUND BLOOD VESSEL UP 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应灰色DN 74 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 182 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 8D UP 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 10D UP 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE UP 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常分裂 57 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Watanabe溃疡性结肠炎与癌症DN 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASTELLANO NRAS TARGETS UP 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 ACUTE LOF UP 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION UP 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT SERUM RESPONSE 120 MCF10A 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT SERUM RESPONSE 240 MCF10A 57 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DER IFN ALPHA RESPONSE UP 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIELAND UP BY HBV INFECTION 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRANDVAUX IRF3 TARGETS UP 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨那对ifng的回应 78 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING UP 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn伽马响应 71 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GILDEA METASTASIS 30 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GREENBAUM E2A TARGETS DN 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAVOR CEBPA TARGETS UP 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT UP 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION UP 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN RESPONSE TO TNF UP 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG IMMORTALIZED BY HPV31 DN 65 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE INTERFERON RESPONSIVE GENES 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV ALL UP 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN RESPONSE TO TNF TROGLITAZONE UP 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEISS RESPONSE TO DSRNA UP 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 10HR UP 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 24 HR UP 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 8小时 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MONNIER POSTRADIATION TUMOR ESCAPE DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA受伽马辐射损伤 81 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WALLACE PROSTATE CANCER RACE UP 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS DN 120 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE DN 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌萧述三腔的DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOSERLE IFNA RESPONSE 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buckanovich t淋巴细胞在肿瘤上 24 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION A 67 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WUNDER INFLAMMATORY RESPONSE AND CHOLESTEROL UP 58 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan早期分化基因dn 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JISON SICKLE CELL DISEASE UP 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POOLA INVASIVE BREAST CANCER UP 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN MCV6 LCP WITH H3K4ME3 162 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN MEF LCP WITH H3K4ME3 128 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG RESPONSE TO H2O2 VIA ERCC6 DN 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 87 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin DN的反应 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE DN 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION 128 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hecker IFNB1目标 95 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因