基因页:GBP2
概括?
基因 | 2634 |
象征 | GBP2 |
同义词 | - |
描述 | 鸟烯基结合蛋白2 |
参考 | MIM:600412|HGNC:HGNC:4183|HPRD:02682| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p22.2 |
Pascal P值 | 0.974 |
DEG P值 | DEG:SANDERS_2014:DS1_P = 0.197:DS1_BETA = 0.003390:DS2_P = 6.85E-02:DS2_BETA = -0.088:DS2_FDR = 2.37E-01 |
胎儿β | -1.02 |
主持人 | 尾状基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Sanders_2013 | 微阵列 | 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GBP2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NR4A3 | 0.69 | 0.70 |
boc | 0.62 | 0.40 |
clstn2 | 0.61 | 0.72 |
COL2A1 | 0.59 | 0.18 |
LATS2 | 0.59 | 0.43 |
Neurod1 | 0.59 | 0.58 |
spty2d1 | 0.59 | 0.69 |
FOXN2 | 0.58 | 0.63 |
IPO8 | 0.58 | 0.65 |
E2F3 | 0.58 | 0.70 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.41 | -0.49 |
增强 | -0.40 | -0.55 |
ifi27 | -0.39 | -0.47 |
TLCD1 | -0.38 | -0.47 |
MT3 | -0.38 | -0.49 |
higd1b | -0.38 | -0.47 |
CST3 | -0.37 | -0.49 |
AF347015.21 | -0.37 | -0.44 |
MT-CO2 | -0.37 | -0.44 |
PLA2G5 | -0.37 | -0.51 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BTBD2 | - | BTB(POZ)包含2个域 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
FXR1 | - | 脆弱的X心理障碍,常染色体同源物1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
HSPE1 | CPN10 |gro |HSP10 | 热冲击10KDA蛋白1(伴侣蛋白10) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
KLHL20 | khlhx |Kleip |klhlx |RP3-383J4.3 | 类似Kelch的20(果蝇) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
LSM2 | C6orf28 |g7b |YBL026W |snrnp | LSM2同源物,U6小核RNA相关(酿酒酵母) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
pafah1b3 | - | 血小板激活因子乙酰水合酶,同工型IB,伽马亚基29KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
PPP1R8 | ard-1 |ard1 |nipp-1 |nipp1 |Pro2047 | 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基8 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SAT1 | DC21 |KFSD |星期六|SSAT |SSAT-1 | 精子/精子N1-乙酰转移酶1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SEPHS1 | MGC4980 |SELD |SPS |SPS1 | 硒磷酸合成酶1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
serpinb9 | CAP-3 |cap3 |PI9 | Serpin肽酶抑制剂,进化枝B(椭圆蛋白),成员9 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
TFG | FLJ36137 |TF6 |trkt3 | TRK融合基因 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome干扰素伽马信号传导 | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素αβ信号传导 | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合的TONKS目标维持在红细胞中 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML静止与正常静止DN | 47 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML划分与正常静止DN | 95 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham正常静止与正常分裂 | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射6的响应6 | 84 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Grandvaux IFN不通过IRF3做出响应 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肯尼CTNNB1靶向DN | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up | 87 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HBV感染的Wieland | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova Prox1靶向DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod目标DN | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗干扰素反应性基因 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乔治塔斯HSC标记 | 71 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向 | 113 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP | 107 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ruiz TNC目标 | 153 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Vav3前列腺致癌作用 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Demagalhaes老化 | 55 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |