概括
基因 2634
象征 GBP2
同义词 -
描述 鸟烯基结合蛋白2
参考 MIM:600412|HGNC:HGNC:4183|HPRD:02682|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p22.2
Pascal P值 0.974
DEG P值 DEG:SANDERS_2014:DS1_P = 0.197:DS1_BETA = 0.003390:DS2_P = 6.85E-02:DS2_BETA = -0.088:DS2_FDR = 2.37E-01
胎儿β -1.02
主持人 尾状基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Sanders_2013 微阵列 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NR4A3 0.69 0.70
boc 0.62 0.40
clstn2 0.61 0.72
COL2A1 0.59 0.18
LATS2 0.59 0.43
Neurod1 0.59 0.58
spty2d1 0.59 0.69
FOXN2 0.58 0.63
IPO8 0.58 0.65
E2F3 0.58 0.70
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.41 -0.49
增强 -0.40 -0.55
ifi27 -0.39 -0.47
TLCD1 -0.38 -0.47
MT3 -0.38 -0.49
higd1b -0.38 -0.47
CST3 -0.37 -0.49
AF347015.21 -0.37 -0.44
MT-CO2 -0.37 -0.44
PLA2G5 -0.37 -0.51

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
BTBD2 - BTB(POZ)包含2个域 两个杂交 Biogrid 16169070
FXR1 - 脆弱的X心理障碍,常染色体同源物1 两个杂交 Biogrid 16169070
HSPE1 CPN10 |gro |HSP10 热冲击10KDA蛋白1(伴侣蛋白10) 两个杂交 Biogrid 16169070
KLHL20 khlhx |Kleip |klhlx |RP3-383J4.3 类似Kelch的20(果蝇) 两个杂交 Biogrid 16169070
LSM2 C6orf28 |g7b |YBL026W |snrnp LSM2同源物,U6小核RNA相关(酿酒酵母) 两个杂交 Biogrid 16169070
pafah1b3 - 血小板激活因子乙酰水合酶,同工型IB,伽马亚基29KDA 两个杂交 Biogrid 16169070
PPP1R8 ard-1 |ard1 |nipp-1 |nipp1 |Pro2047 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基8 两个杂交 Biogrid 16169070
SAT1 DC21 |KFSD |星期六|SSAT |SSAT-1 精子/精子N1-乙酰转移酶1 两个杂交 Biogrid 16169070
SEPHS1 MGC4980 |SELD |SPS |SPS1 硒磷酸合成酶1 两个杂交 Biogrid 16169070
serpinb9 CAP-3 |cap3 |PI9 Serpin肽酶抑制剂,进化枝B(椭圆蛋白),成员9 两个杂交 Biogrid 16169070
TFG FLJ36137 |TF6 |trkt3 TRK融合基因 两个杂交 Biogrid 16169070


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome干扰素伽马信号传导 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素αβ信号传导 64 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合的TONKS目标维持在红细胞中 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常静止DN 47 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML划分与正常静止DN 95 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham正常静止与正常分裂 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射6的响应6 84 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Grandvaux IFN不通过IRF3做出响应 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肯尼CTNNB1靶向DN 52 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HBV感染的Wieland 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova Prox1靶向DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delaserna Myod目标DN 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗干扰素反应性基因 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乔治塔斯HSC标记 71 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC目标 153 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Demagalhaes老化 55 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因