基因页:GBX1
概括?
基因 | 2636 |
象征 | GBX1 |
同义词 | 嗯17 |
描述 | 胃脑大脑同源1 |
参考 | MIM:603354|HGNC:HGNC:4185|Ensembl:ENSG00000164900|Vega:Otthumg00000158751 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q36.1 |
Pascal P值 | 0.028 |
胎儿β | -0.865 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:6 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00643862 | 7 | 150865186 | GBX1 | 3.001E-4 | -0.241 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GBX1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
去:0003700 | 转录因子活性 | nas | - | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007411 | 轴突指导 | IEA | Axon(GO期限:13) | - |
去:0030902 | 后脑发展 | IEA | 大脑(GO期限:8) | - |
GO:0021555 | 中脑 - 脑边界形态发生 | IEA | 大脑(GO期限:11) | - |
GO:0021549 | 小脑发育 | IEA | 大脑(GO期限:10) | - |
去:0021930 | 颗粒细胞前体增殖 | IEA | 神经元,谷氨酸(GO期限:11) | - |
GO:0048483 | 自主神经系统发展 | IEA | 神经元(GO期限:6) | - |
去:0001755 | 神经rest细胞迁移 | IEA | - | |
去:0001569 | 血管 | IEA | - | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | nas | - | |
去:0008283 | 细胞增殖 | IEA | - | |
GO:0042472 | 内耳形态发生 | IEA | - | |
GO:0021568 | 菱形2发展 | IEA | - | |
GO:0035239 | 管形态发生 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0000228 | 核染色体 | nas | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |