概括
基因 2636
象征 GBX1
同义词 嗯17
描述 胃脑大脑同源1
参考 MIM:603354|HGNC:HGNC:4185|Ensembl:ENSG00000164900|Vega:Otthumg00000158751
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q36.1
Pascal P值 0.028
胎儿β -0.865
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:6

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00643862 7 150865186 GBX1 3.001E-4 -0.241 0.04 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 IEA -
去:0003700 转录因子活性 nas -
GO:0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007411 轴突指导 IEA Axon(GO期限:13) -
去:0030902 后脑发展 IEA 大脑(GO期限:8) -
GO:0021555 中脑 - 脑边界形态发生 IEA 大脑(GO期限:11) -
GO:0021549 小脑发育 IEA 大脑(GO期限:10) -
去:0021930 颗粒细胞前体增殖 IEA 神经元,谷氨酸(GO期限:11) -
GO:0048483 自主神经系统发展 IEA 神经元(GO期限:6) -
去:0001755 神经rest细胞迁移 IEA -
去:0001569 血管 IEA -
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 nas -
去:0008283 细胞增殖 IEA -
GO:0042472 内耳形态发生 IEA -
GO:0021568 菱形2发展 IEA -
GO:0035239 管形态发生 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000228 核染色体 nas -
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因