基因页:GC
概括?
基因 | 2638 |
象征 | GC |
同义词 | dbp | dbp/gc | grd3 | gc-maf | gcmaf | hel-s-51 | vdbg | vdbp |
描述 | 组特异性成分(维生素D结合蛋白) |
参考 | MIM:139200|HGNC:HGNC:4187|ENSEMBL:ENSG00000145321|HPRD:00749|Vega:Otthumg00000129915 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q12-Q13 |
Pascal P值 | 0.019 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07376029 | 4 | 72650992 | GC | 5.59e-5 | -0.49 | 0.022 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GC_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | IPI | 12119014 | |
去:0005499 | 维生素D结合 | IEA | - | |
去:0005499 | 维生素D结合 | 塔斯 | 1696927 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12119014 | |
GO:0051183 | 维生素转运蛋白活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
GO:0042359 | 维生素D代谢过程 | IEA | - | |
GO:0051180 | 维生素转运 | 塔斯 | 1696927 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005813 | 中心体 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | nas | 14718574 | |
去:0005615 | 细胞外空间 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
类固醇激素和维生素A和D的反应组代谢 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组类固醇激素 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN | 175 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤区域 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lein脉络丛标记 | 103 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向DN | 108 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshioka肝癌早期复发DN | 65 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗HCMV感染30分钟 | 56 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向DN | 109 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |