概括
基因 2638
象征 GC
同义词 dbp | dbp/gc | grd3 | gc-maf | gcmaf | hel-s-51 | vdbg | vdbp
描述 组特异性成分(维生素D结合蛋白)
参考 MIM:139200|HGNC:HGNC:4187|ENSEMBL:ENSG00000145321|HPRD:00749|Vega:Otthumg00000129915
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q12-Q13
Pascal P值 0.019
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07376029 4 72650992 GC 5.59e-5 -0.49 0.022 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003779 肌动蛋白结合 IPI 12119014
去:0005499 维生素D结合 IEA -
去:0005499 维生素D结合 塔斯 1696927
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12119014
GO:0051183 维生素转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006810 运输 IEA -
GO:0042359 维生素D代谢过程 IEA -
GO:0051180 维生素转运 塔斯 1696927
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005813 中心体 艾达 18029348
去:0005576 细胞外区域 nas 14718574
去:0005615 细胞外空间 IEA -
去:0005737 细胞质 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
类固醇激素和维生素A和D的反应组代谢 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组类固醇激素 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN 175 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤区域 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lein脉络丛标记 103 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshioka肝癌早期复发DN 65 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染30分钟 56 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因