概括
基因 26470
象征 SEZ6L2
同义词 BSRPA | PSK-1
描述 癫痫发作相关6个同源物(鼠标)-2
参考 MIM:616667|HGNC:HGNC:30844|Ensembl:ENSG00000174938|HPRD:06686|Vega:Otthumg00000132112
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p11.2
Pascal P值 1.436E-7
Sherlock P值 0.02
胎儿β -1.464
主持人 小脑半球
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:2.294
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王攀登目标 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 83 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A5 70 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-138 172 178 1a HSA-MIR-138 Agcugguuguguugaauc
mir-299-5p 169 175 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau