基因页：CNNM3
概括？
| 基因 | 26505 |
| 象征 | CNNM3 |
| 同义词 | acdp3 |
| 描述 | Cyclin和CBS结构域二价金属阳离子传输中介3 |
| 参考 | MIM：607804|HGNC：HGNC：104|HPRD：07419| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2P12-P11.2 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| Sherlock P值 | 0.688 |
| DEG P值 | DEG：ZHAO_2015：P = 4.89E-05：Q = 0.0489 |
| 胎儿β | 0.847 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Zhao_2015 | RNA测序分析 | 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。 | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0004 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CNNM3 | CHR2 | 97493918 | C | 一个 | NM_017623 NM_199078 |
p.591t> n p.543t> n |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | CNNM3 | 26505 | 4.359E-14 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | CNNM3 | 26505 | 3.929E-4 | 反式 | ||
| RS3106445 | CHR3 | 165326464 | CNNM3 | 26505 | 0.16 | 反式 | ||
| RS520325 | CHR3 | 165361016 | CNNM3 | 26505 | 0.11 | 反式 | ||
| RS2183142 | CHR4 | 159232695 | CNNM3 | 26505 | 0.06 | 反式 | ||
| RS9993289 | CHR4 | 160724785 | CNNM3 | 26505 | 0.03 | 反式 | ||
| RS4691618 | CHR4 | 160749122 | CNNM3 | 26505 | 0 | 反式 | ||
| RS1031637 | CHR4 | 160759123 | CNNM3 | 26505 | 0.03 | 反式 | ||
| RS897930 | CHR4 | 160759355 | CNNM3 | 26505 | 0.03 | 反式 | ||
| RS4280696 | CHR4 | 160762239 | CNNM3 | 26505 | 0.03 | 反式 | ||
| RS1457804 | CHR4 | 160766410 | CNNM3 | 26505 | 0.03 | 反式 | ||
| RS2061337 | CHR4 | 160768115 | CNNM3 | 26505 | 0.03 | 反式 | ||
| RS1379601 | CHR4 | 160775476 | CNNM3 | 26505 | 0.03 | 反式 | ||
| SNP_A-4218600 | 0 | CNNM3 | 26505 | 0.08 | 反式 | |||
| RS7787830 | CHR7 | 98797019 | CNNM3 | 26505 | 0.03 | 反式 | ||
| RS3118341 | Chr9 | 25185518 | CNNM3 | 26505 | 0.15 | 反式 | ||
| RS17176921 | Chr10 | 50580874 | CNNM3 | 26505 | 0.07 | 反式 | ||
| RS2393316 | Chr10 | 59333070 | CNNM3 | 26505 | 0.09 | 反式 | ||
| RS4265582 | Chr11 | 18797649 | CNNM3 | 26505 | 0.08 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CNNM3 | 26505 | 9.324e-13 | 反式 | ||
| RS1041786 | CHR21 | 22617710 | CNNM3 | 26505 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对Bexarotene的反应 | 34 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-143 | 264 | 270 | M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
| mir-182 | 568 | 574 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-96 | 567 | 574 | 1A，M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |