基因页：INTS6

Summary？
基因ID 26512
Symbol INTS6
同义词 dbi-1 | ddx26 | ddx26a | dice1 | hdb | int6 | notchl2
描述 集成商复合体亚基6
参考 MIM：604331|HGNC:HGNC:14879|ENSEMBL：ENSG00000102786|HPRD：05063|Vega：Otthumg0000000016945
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q14.3
Pascal P值 0.186
胎儿β 0.301
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
支持 CompositeSet

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 Sift CG46 特征 学习
INTS6 CHR13 51961614 t G NM_001039937
NM_012141		 p.255I>L
p.268i> l		 错义
错义		 Schizophrenia DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG08028037 13 52027479 INTS6 6.49e-6 -0.248 0.012 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0004888 跨膜衰退ptor activity 塔斯 10467397
去：0003676 核酸结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 17310990
去：0005524 ATP结合 IEA -
去：0008026 ATP-dependent helicase activity IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016180 snRNA处理 艾达 16239144
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005856 细胞骨架 艾达 18029348
去：0005634 核 IEA -
去：0005730 核仁 艾达 18029348
去：0032039 集成商复合物 艾达 16239144

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标 473 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌 404 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graham CML静止与正常分裂 57 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应表皮DN 508 354 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
XU GH1外源目标DN 120 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利伪虫 43 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足趋化趋化性 74 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足 518 299 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE DN 204 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 1227 1233 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-129-5p 350 356 1a HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 489 495 M8 HSA-MIR-17-5P CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
hsa-miR-519d caaagugccucccuuuagugugu
mir-182 346 353 1A，M8 HSA-MIR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
HSA-MIR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
MiR-200BC/429 2988 2994 M8 hsa-miR-200b uaauacugccugguaaugaugac
hsa-miR-200c uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-218 2938 2944 1a HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-299-5p 304 310 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-381 418 424 1a HSA-MIR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir-384 539 545 1a HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-455 391 397 1a HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg
miR-493-5p 455 461 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
miR-495 494 500 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 488 494 M8 HSA-MIR-93脑 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu
miR-96 347 353 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc