概括
基因 26576
象征 SRPK3
同义词 MSSK-1 | MSSK1 | STK23
描述 SRSF蛋白激酶3
参考 HGNC:HGNC:11402|ENSEMBL:ENSG00000184343|HPRD:06731|Vega:Otthumg00000024207
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XQ28
Sherlock P值 9.335E-4
胎儿β -0.52
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2491110 CHR1 117475981 SRPK3 26576 0.14 反式
RS16829545 CHR2 151977407 SRPK3 26576 0 反式
RS12359579 Chr10 87511020 SRPK3 26576 0.07 反式
RS16955618 CHR15 29937543 SRPK3 26576 1.259E-5 反式
RS17782355 CHR19 55807585 SRPK3 26576 0.17 反式
RS16993189 Chrx 144666166 SRPK3 26576 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 nas -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 nas -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007519 骨骼肌发育 IEA 神经元(GO期限:8) -
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 nas -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori浆细胞DN 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yu Myc针对DN 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein CTNNB1途径 33 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 31 38 1A,M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC