基因页:SRPK3
概括?
基因 | 26576 |
象征 | SRPK3 |
同义词 | MSSK-1 | MSSK1 | STK23 |
描述 | SRSF蛋白激酶3 |
参考 | HGNC:HGNC:11402|ENSEMBL:ENSG00000184343|HPRD:06731|Vega:Otthumg00000024207 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ28 |
Sherlock P值 | 9.335E-4 |
胎儿β | -0.52 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2491110 | CHR1 | 117475981 | SRPK3 | 26576 | 0.14 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | SRPK3 | 26576 | 0 | 反式 | ||
RS12359579 | Chr10 | 87511020 | SRPK3 | 26576 | 0.07 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | SRPK3 | 26576 | 1.259E-5 | 反式 | ||
RS17782355 | CHR19 | 55807585 | SRPK3 | 26576 | 0.17 | 反式 | ||
RS16993189 | Chrx | 144666166 | SRPK3 | 26576 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SRPK3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | nas | - | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | nas | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007519 | 骨骼肌发育 | IEA | 神经元(GO期限:8) | - |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | nas | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005575 | cellular_component | nd | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori浆细胞DN | 33 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yu Myc针对DN | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌ERBB2 UP | 147 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein CTNNB1途径 | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124/506 | 31 | 38 | 1A,M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC |