基因页：Grem1
概括？
| 基因 | 26585 |
| 象征 | Grem1 |
| 同义词 | C15DUPQ | CKTSF1B1 | CRAC1 | CRCS4 | DAND2 | DRM | DUP15Q | GREMLIN | HMPS | HMPS1 | IHG-2 | MPSH | MPSH | PIG2 |
| 描述 | Gremlin 1，Dan Family BMP对手 |
| 参考 | MIM：603054|HGNC：HGNC：2001|HPRD：07048| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q13.3 |
| Pascal P值 | 0.005 |
| 胎儿β | -0.5 |
| 主持人 | 海马 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Grem1 | CHR15 | 33023398 | 一个 | G | NM_001191322 NM_001191323 NM_013372 |
。 。 。 |
沉默的 沉默的 沉默的 |
精神分裂症 | DNM：Gulsuner_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16854353 | CHR1 | 179531607 | Grem1 | 26585 | 0.11 | 反式 | ||
| RS11120206 | CHR1 | 206610593 | Grem1 | 26585 | 0.02 | 反式 | ||
| RS11899693 | CHR2 | 64171418 | Grem1 | 26585 | 0.01 | 反式 | ||
| RS1527174 | CHR2 | 78146421 | Grem1 | 26585 | 0.18 | 反式 | ||
| RS1527175 | CHR2 | 78149450 | Grem1 | 26585 | 0.18 | 反式 | ||
| RS2729048 | CHR3 | 602688 | Grem1 | 26585 | 0.01 | 反式 | ||
| RS4144528 | CHR5 | 6841145 | Grem1 | 26585 | 0.18 | 反式 | ||
| RS9380492 | CHR6 | 35100415 | Grem1 | 26585 | 0.07 | 反式 | ||
| RS3800387 | CHR6 | 35186500 | Grem1 | 26585 | 0.07 | 反式 | ||
| RS12173582 | CHR6 | 35340299 | Grem1 | 26585 | 0.07 | 反式 | ||
| RS17075386 | CHR6 | 114025208 | Grem1 | 26585 | 0.08 | 反式 | ||
| RS17052544 | CHR6 | 114026836 | Grem1 | 26585 | 0.08 | 反式 | ||
| RS7805427 | CHR7 | 22103377 | Grem1 | 26585 | 0.07 | 反式 | ||
| RS6984890 | CHR8 | 61770963 | Grem1 | 26585 | 0.04 | 反式 | ||
| RS16924550 | CHR12 | 22174951 | Grem1 | 26585 | 0.07 | 反式 | ||
| RS17730330 | CHR12 | 92998513 | Grem1 | 26585 | 0.08 | 反式 | ||
| RS17076670 | CHR13 | 22952101 | Grem1 | 26585 | 0.01 | 反式 | ||
| RS7319578 | CHR13 | 82129005 | Grem1 | 26585 | 0 | 反式 | ||
| RS17821412 | CHR16 | 57938754 | Grem1 | 26585 | 0.01 | 反式 | ||
| RS184583 | CHR19 | 30371589 | Grem1 | 26585 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005125 | 细胞因子活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16545136 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 9660951 |
| 去：0001658 | 输尿管芽分支 | IEA | - | |
| 去：0009954 | 近端/远端模式形成 | IEA | - | |
| 去：0007267 | 细胞细胞信号传导 | IEA | - | |
| 去：0009887 | 器官形态发生 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | 塔斯 | 9660951 | |
| 去：0030514 | BMP信号通路的负调节 | IEA | - | |
| 去：0030326 | 胚胎肢体发生 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 9660951 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID BMP途径 | 42 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahadevan伊马替尼抵抗 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Mycn扩增靶向 | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| co牛MYCN目标 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 | 83 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramaswamy转移DN | 61 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kuninger IGF1 vs PDGFB目标DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线响应集群D1 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Labbe Wnt3a靶向 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schraets MLL靶向DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hinata NFKB靶向成纤维细胞 | 84 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama FGF2目标 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP | 87 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 | 157 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| STAT3的Azare肿瘤转化 | 121 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Winzen通过KHSRP退化 | 100 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| anastassiou癌症间充质过渡特征 | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM有关联 | 171 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-128 | 2774 | 2781 | 1A，M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| mir-137 | 2981 | 2988 | 1A，M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| mir-181 | 2952 | 2958 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-23 | 2710 | 2717 | 1A，M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-27 | 2775 | 2781 | M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-323 | 2710 | 2716 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
| mir-543 | 2953 | 2959 | M8 | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |