概括
基因 2668
象征 gdnf
同义词 atf1 | atf2 | hfb1-gdnf | hscr3
描述 神经胶质细胞得出的神经营养因子
参考 MIM:600837|HGNC:HGNC:4232|ENSEMBL:ENSG00000168621|HPRD:02906|Vega:Otthumg0000000090809
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5P13.1-P12
Pascal P值 0.03
胎儿β -0.033
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:4

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21319053 5 37840725 gdnf 1.058E-4 -0.469 0.028 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008083 生长因子活性 IEA -
去:0008083 生长因子活性 nas -
GO:0042803 蛋白质同构化活性 艾达 8493557|8988018
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0051584 多巴胺摄取的调节 艾达 突触,神经递质,多巴胺(GO期限:11) 8493557
去:0031175 神经突发育 艾达 神经元,轴突,神经突,树突(GO期限:10) 15242795
GO:0043524 神经元细胞凋亡的阴性调节 艾达 神经元(GO期限:9) 8493557
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 8637574
去:0001755 神经rest细胞迁移 艾达 15242795
去:0007165 信号转导 塔斯 7830769
去:0008150 生物_Process nd -
去:0006916 抗凋亡 塔斯 7830769
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 艾达 9811930

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID RET路径 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid ajdiss 2Pathway 48 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM1相互作用 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM信号传导,用于神经突的生长 64 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 UP 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化克拉斯 126 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标dn 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova在APL中甲基化 68 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌中甲基化的甲基化 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk男性繁殖Sertoli 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
雷·阿尔茨海默氏病 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Thoc1靶向DN 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi直接辐照 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WARTERS红外响应5GY 47 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因