基因页：GFAP
概括？
| 基因 | 2670 |
| 象征 | GFAP |
| 同义词 | alxdrd |
| 描述 | 胶质原纤维酸性蛋白 |
| 参考 | MIM：137780|HGNC：HGNC：4235|ENSEMBL：ENSG00000131095|HPRD：00675|Vega：Otthumg00000179866 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17Q21 |
| Pascal P值 | 0.359 |
| Sherlock P值 | 0.757 |
| 胎儿beta | -1.865 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共同表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| APBB3 | 0.88 | 0.87 |
| SGSM3 | 0.86 | 0.86 |
| ABCB9 | 0.85 | 0.83 |
| MAP3K12 | 0.85 | 0.83 |
| NICN1 | 0.85 | 0.82 |
| C16orf58 | 0.85 | 0.80 |
| kat2a | 0.85 | 0.83 |
| TMEM25 | 0.84 | 0.84 |
| scyl1 | 0.84 | 0.82 |
| PCYOX1L | 0.84 | 0.80 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.2 | -0.66 | -0.49 |
| AF347015.21 | -0.65 | -0.51 |
| AL139819.3 | -0.65 | -0.63 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.51 |
| AF347015.8 | -0.64 | -0.50 |
| MT-CO2 | -0.64 | -0.49 |
| mt-cyb | -0.63 | -0.49 |
| AF347015.18 | -0.62 | -0.53 |
| AF347015.26 | -0.62 | -0.47 |
| AF347015.15 | -0.60 | -0.45 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005200 | 细胞骨架的结构成分 | tas | 2740350 | |
| 细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005882 | 中间细丝 | tas | 2740350 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节蛋白质 - 蛋白质相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CEP76 | C18orf9 |FLJ12542 |HST1705 | 中心蛋白76KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| grap2 | gads |grap-2 |grb2l |grblg |网格|grpl |grbx |grf40 |蒙娜|p38 | 与GRB2相关的衔接蛋白2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| KIAA0408 | FLJ43995 |RP3-403A15.2 | KIAA0408 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| Men1 | meai |SCG2 | 多内分泌肿瘤I | - | HPRD，Biogrid | 12169273 |
| myo15b | FLJ21606 |FLJ22686 |FLJ40577 |FLJ44494 |myo15bp | 肌球蛋白XVB假元 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PDLIM1 | 攀登1 |CLP-36 |clp36 |HClim1 | PDZ和LIM域1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PDLIM7 | LMP1 | PDZ和LIM域7（Enigma） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PDZK1 | CAP70 |夹具|nherf3 |PDZD1 | PDZ域包含1个 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| POM121 | DKFZP586G1822 |DKFZP586P2220 |FLJ41820 |KIAA0618 |MGC3792 |POM121A | POM121膜糖蛋白（大鼠） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PSEN1 | ad3 |时尚|PS1 |S182 | Presenilin 1 | - | HPRD，Biogrid | 12058025 |
| PSEN2 | AD3L |ad4 |PS2 |STM2 | Presenilin 2（阿尔茨海默氏病4） | 两个杂交 | Biogrid | 12058025 |
| RIBC2 | C22orf11 | 带盘螺旋2的RIB43A域2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| S100A1 | S100 |S100-Alpha |S100A | S100钙结合蛋白A1 | - | HPRD | 10510252 |
| S100B | nef |S100 |S100beta | S100钙结合蛋白B | - | HPRD | 10510252 |
| Sh3yl1 | DKFZP586F1318 |FLJ39121 |射线 | SH3域含有YSC84样1（S. cerevisiae） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| src | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | V-SRC肉瘤（Schmidt-Ruppin A-2）病毒癌基因同源物（Avian） | - | HPRD | 11379820 |
| TUBGCP4 | 76p |FLJ14797 |GCP4 | 微管蛋白，伽马复合物相关蛋白4 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| vim | FLJ36605 | 波形蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB4的Reactome核信号传导 | 38 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤上升 | 35 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈肺癌的生存 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染16小时DN | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu衰老的大脑 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Neotex up | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李小脑老化 | 84 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen Schwannoma Up | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin Mgmt 48小时DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein星形胶质细胞标记 | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的甲基化 | 56 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI葡萄糖剥夺 | 60 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng Werner综合症和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Demagalhaes老化 | 55 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |