概括
基因 26707
象征 OR2J2
同义词 OR6-19 | OR6-8 | OR6.3.8 | ORL684 | DJ80I19.4 | HS6M1-6
描述 嗅觉受体家族2亚家族J成员2
参考 HGNC:HGNC:8260|Ensembl:ENSG00000204700|HPRD:17700|Vega:Otthumg00000031091
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6P22.2-P21.31
Pascal P值 1E-12
胎儿β -0.458
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00609291 6 29141565 OR2J2 1.289E-4 -0.458 0.03 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 OR2J2 26707 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0004984 嗅觉受体活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0007608 气味的感官感知 IEA -
GO:0050896 对刺激的反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg嗅觉转导 389 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因