概括
基因 2672
象征 GFI1
同义词 gfi-1 | gfi1a | scn2 | znf163
描述 生长因子独立1转录阻遏物
参考 MIM:600871|HGNC:HGNC:4237|ENSEMBL:ENSG00000162676|HPRD:07527|Vega:Otthumg0000000010897
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p22
Pascal P值 5.421E-4
胎儿β -0.975
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 4
DMG:Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 4

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04535902 1 92947332 GFI1 5.73E-6 -0.013 0.031 DMG:Montano_2016
CG24517501 1 92952702 GFI1 1.3e-5 -0.008 0.05 DMG:Montano_2016
CG04777348 1 92952897 GFI1 9.77e-5 -0.007 0.12 DMG:Montano_2016
CG14475915 1 92952268 GFI1 8.73e-8 -0.015 2.01E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
pid myc抑制道路 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson遗传毒性签名 105 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇5 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEART HDAC增殖集群DN 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3 t淋巴细胞DN中的靶标 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vilimas Notch1靶向DN 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee早期T淋巴细胞向上 107 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 102 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
全部难治性治疗 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr dn 37 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇1 DN 48 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 151 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因