基因页:GFI1
概括?
基因 | 2672 |
象征 | GFI1 |
同义词 | gfi-1 | gfi1a | scn2 | znf163 |
描述 | 生长因子独立1转录阻遏物 |
参考 | MIM:600871|HGNC:HGNC:4237|ENSEMBL:ENSG00000162676|HPRD:07527|Vega:Otthumg0000000010897 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p22 |
Pascal P值 | 5.421E-4 |
胎儿β | -0.975 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 4 |
DMG:Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04535902 | 1 | 92947332 | GFI1 | 5.73E-6 | -0.013 | 0.031 | DMG:Montano_2016 |
CG24517501 | 1 | 92952702 | GFI1 | 1.3e-5 | -0.008 | 0.05 | DMG:Montano_2016 |
CG04777348 | 1 | 92952897 | GFI1 | 9.77e-5 | -0.007 | 0.12 | DMG:Montano_2016 |
CG14475915 | 1 | 92952268 | GFI1 | 8.73e-8 | -0.015 | 2.01E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GFI1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
pid myc抑制道路 | 63 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shin B细胞淋巴瘤簇5 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PEART HDAC增殖集群DN | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3 t淋巴细胞DN中的靶标 | 37 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vilimas Notch1靶向DN | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee早期T淋巴细胞向上 | 107 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
全部难治性治疗 | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手DN | 116 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr dn | 37 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇1 DN | 48 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |