基因页面:GFRA3
总结吗?
GeneID | 2676年 |
象征 | GFRA3 |
同义词 | GDNFR3 |
描述 | GDNF家族受体α3 |
参考 | MIM: 605710|HGNC: HGNC: 4245|运用:ENSG00000146013|HPRD: 10420|织女:OTTHUMG00000129200 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 5 q31.1-q31.3 |
帕斯卡假定值 | 0.044 |
胎儿β | 0.413 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0032 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:6 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg21225170 | 5 | 137610391 | GFRA3 | 9.31 e-8 | -0.022 | 2.11 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GFRA3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MYO18B | 0.34 | 0.18 |
CHRNA6 | 0.33 | 0.11 |
CHRNA3 | 0.30 | 0.24 |
GRID2IP | 0.30 | 0.24 |
COX6A2 | 0.29 | 0.21 |
不良贷款 | 0.29 | 0.16 |
ABCA13 | 0.29 | 0.19 |
MYO3B | 0.29 | 0.18 |
RGS16 | 0.28 | 0.12 |
PARVG | 0.28 | 0.14 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TRPV6 | -0.16 | -0.19 |
PNLDC1 | -0.16 | -0.17 |
KCNS1 | -0.13 | -0.07 |
AC016705.1 | -0.13 | -0.11 |
AC011472.2 | -0.13 | -0.08 |
RBP7 | -0.13 | -0.17 |
CPS1 | -0.13 | -0.15 |
KIAA0748 | -0.13 | -0.20 |
AC083862.2 | -0.12 | -0.12 |
C13orf16 | -0.12 | -0.17 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008046 | 轴突引导受体活动 | 国际能源机构 | 轴突(术语层面:6) | - - - - - - |
去:0005102 | 受体结合 | 助教 | 神经递质(术语级别:4) | 9407096 |
去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007411 | 轴突的指导 | 国际能源机构 | 轴突(术语层面:13) | - - - - - - |
去:0001764 | 神经元迁移 | 国际能源机构 | 神经元(术语层面:8) | - - - - - - |
去:0048666 | 神经元的发展 | 国际能源机构 | 神经元(术语层面:9) | - - - - - - |
去:0048485 | 交感神经系统发展 | 国际能源机构 | 神经元,神经递质(术语层面:7) | - - - - - - |
去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 9490034|9576965 | |
去:0007422 | 外围神经系统发育 | 助教 | 9576965 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0009897 | 质膜外的一面 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0031225 | 固定在膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0019898 | 外在膜 | 助教 | 9490034 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
萨瓦特结直肠腺瘤DN | 291年 | 176年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
康被叔DN | 102年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RIZKI肿瘤侵袭性的3 d DN | 270年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K27ME3 | 269年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ASGHARZADEH神经母细胞瘤穷人生存DN | 46 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 224 | 581年 | 587年 | 1 | hsa - mir - 224 | CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA |