基因页：GGCX

概括？
基因 2677
象征 GGCX
同义词 VKCFD1
描述 γ-谷氨酰胺羧化酶
参考 MIM：137167|HGNC：HGNC：4247|ENSEMBL：ENSG00000115486|HPRD：00665|Vega：Otthumg00000130173
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P12
Pascal P值 0.265
Sherlock P值 0.04
胎儿β -0.449
DMG 1（＃研究）
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
下丘脑
伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0004

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG13174083 2 85788758 GGCX 2.73E-9 -0.025 1.95E-6 DMG：JAFFE_2016
CG17127132 2 85788382 GGCX 5.31E-8 -0.016 1.38e-5 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6738009 2 85737509 GGCX ENSG00000115486.7 1.759E-7 0 51161 gtex_brain_ba24
RS7591175 2 85738374 GGCX ENSG00000115486.7 6.655E-7 0 50296 gtex_brain_ba24
RS2166529 2 85742175 GGCX ENSG00000115486.7 1.3e-7 0 46495 gtex_brain_ba24
RS6750847 2 85758144 GGCX ENSG00000115486.7 1.458E-6 0 30526 gtex_brain_ba24
RS6731005 2 85760395 GGCX ENSG00000115486.7 5.769e-8 0 28275 gtex_brain_ba24
RS6705839 2 85761279 GGCX ENSG00000115486.7 1.188E-7 0 27391 gtex_brain_ba24
RS6705971 2 85761417 GGCX ENSG00000115486.7 2.759E-7 0 27253 gtex_brain_ba24
RS10175792 2 85761654 GGCX ENSG00000115486.7 2.409E-7 0 27016 gtex_brain_ba24
RS10176176 2 85762048 GGCX ENSG00000115486.7 5.893E-8 0 26622 gtex_brain_ba24
RS10179195 2 85762761 GGCX ENSG00000115486.7 2.749E-7 0 25909 gtex_brain_ba24
RS6714157 2 85763274 GGCX ENSG00000115486.7 2.028e-6 0 25396 gtex_brain_ba24
RS6743030 2 85763520 GGCX ENSG00000115486.7 2.744e-7 0 25150 gtex_brain_ba24
RS3755014 2 85764006 GGCX ENSG00000115486.7 5.769e-8 0 24664 gtex_brain_ba24
RS3755015 2 85764041 GGCX ENSG00000115486.7 5.769e-8 0 24629 gtex_brain_ba24
RS1446668 2 85764960 GGCX ENSG00000115486.7 9.1e-7 0 23710 gtex_brain_ba24
RS2028900 2 85767735 GGCX ENSG00000115486.7 1.842E-7 0 20935 gtex_brain_ba24
RS1078004 2 85769711 GGCX ENSG00000115486.7 5.769e-8 0 18959 gtex_brain_ba24
RS7605975 2 85772548 GGCX ENSG00000115486.7 5.888e-8 0 16122 gtex_brain_ba24
RS12473819 2 85773061 GGCX ENSG00000115486.7 2.064e-7 0 15609 gtex_brain_ba24
RS6547621 2 85774676 GGCX ENSG00000115486.7 5.769e-8 0 13994 gtex_brain_ba24
RS5832649 2 85776490 GGCX ENSG00000115486.7 7.418e-8 0 12180 gtex_brain_ba24
RS6738645 2 85783128 GGCX ENSG00000115486.7 5.881E-8 0 5542 gtex_brain_ba24
RS7568458 2 85788175 GGCX ENSG00000115486.7 7.041E-8 0 495 gtex_brain_ba24
RS11891260 2 85796101 GGCX ENSG00000115486.7 2.064e-7 0 -7431 gtex_brain_ba24
RS1561198 2 85809989 GGCX ENSG00000115486.7 5.769e-8 0 -21319 gtex_brain_ba24
RS55971080 2 85812746 GGCX ENSG00000115486.7 1.745e-8 0 -24076 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016874 连接酶活性 IEA -
去：0008488 γ-谷氨酰羧化酶活性 塔斯 1749935
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006464 蛋白质修饰过程 塔斯 1749935
去：0007596 血液凝血 塔斯 9845520
GO：0017187 肽基 - 谷氨酸羧酸 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005789 内质网膜 IEA -
去：0005624 膜分数 塔斯 1749935
去：0005783 内质网 IEA -
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 塔斯 1749935

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Reactome PTM伽马羧酸羧酸盐酸盐和芳基硫酸酯酶激活 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Gamma羧化运输和蛋白质的氨基末端切割 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues DCC目标DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标8小时DN 129 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存DN 113 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因