概括
基因 2693
象征 GHSR
同义词 GHDP
描述 生长激素秘密受体
参考 MIM:601898|HGNC:HGNC:4267|ENSEMBL:ENSG00000121853|HPRD:03541|Vega:Otthumg00000156946
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q26.31
Pascal P值 0.627
胎儿β 0.173
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 GHSR 2693 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CABP1 0.82 0.68
CCDC64B 0.76 0.65
GLS2 0.75 0.68
anxa11 0.74 0.73
ABTB1 0.74 0.68
tecr 0.74 0.62
iscu 0.74 0.66
ACTR1B 0.74 0.60
PRSS16 0.74 0.64
P2RX6 0.73 0.69
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PKN1 -0.44 -0.51
pde9a -0.42 -0.53
nkiras2 -0.42 -0.36
SH2B2 -0.41 -0.54
tubb2b -0.40 -0.54
SH3BP2 -0.40 -0.52
KIAA1949 -0.40 -0.48
FADS2 -0.39 -0.41
marcksl1 -0.39 -0.44
YBX1 -0.39 -0.48

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001616 生长激素秘密受体活性 艾达 8688086
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0016520 生长激素释放激素受体活性 艾达 8688086
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0051963 突触发生的调节 IEA 突触(GO期限:9) -
GO:0030252 生长激素分泌 塔斯 16511605
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 艾达 8688086
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0008343 成人喂养行为 ISS -
去:0009755 激素介导的信号传导 艾达 8688086
去:0008154 肌动蛋白聚合或解聚 艾达 15232612
GO:0032100 食欲的积极调节 ISS -
去:0040018 多细胞生物生长的阳性调节 小鬼 16511605
GO:0032691 白介素-1β产生的负调节 艾达 15232612
GO:0042536 肿瘤坏死因子生物合成过程的负调控 艾达 15232612
GO:0050728 炎症反应的负调节 艾达 15232612
GO:0043568 胰岛素样生长因子受体信号通路的正调控 IEA -
去:0046697 义词化 艾达 17494105
GO:0045409 白介素-6生物合成过程的负调节 艾达 15232612
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0043005 神经元投影 艾达 神经元,轴突,神经突,树突(GO期限:5) 12890514
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0009986 细胞表面 艾达 8688086
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0045121 膜筏 艾达 15232612

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽配体结合受体 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha Q信号事件 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因