基因页:GHSR
概括?
基因 | 2693 |
象征 | GHSR |
同义词 | GHDP |
描述 | 生长激素秘密受体 |
参考 | MIM:601898|HGNC:HGNC:4267|ENSEMBL:ENSG00000121853|HPRD:03541|Vega:Otthumg00000156946 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q26.31 |
Pascal P值 | 0.627 |
胎儿β | 0.173 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | GHSR | 2693 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GHSR_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CABP1 | 0.82 | 0.68 |
CCDC64B | 0.76 | 0.65 |
GLS2 | 0.75 | 0.68 |
anxa11 | 0.74 | 0.73 |
ABTB1 | 0.74 | 0.68 |
tecr | 0.74 | 0.62 |
iscu | 0.74 | 0.66 |
ACTR1B | 0.74 | 0.60 |
PRSS16 | 0.74 | 0.64 |
P2RX6 | 0.73 | 0.69 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PKN1 | -0.44 | -0.51 |
pde9a | -0.42 | -0.53 |
nkiras2 | -0.42 | -0.36 |
SH2B2 | -0.41 | -0.54 |
tubb2b | -0.40 | -0.54 |
SH3BP2 | -0.40 | -0.52 |
KIAA1949 | -0.40 | -0.48 |
FADS2 | -0.39 | -0.41 |
marcksl1 | -0.39 | -0.44 |
YBX1 | -0.39 | -0.48 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0001616 | 生长激素秘密受体活性 | 艾达 | 8688086 | |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0016520 | 生长激素释放激素受体活性 | 艾达 | 8688086 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0051963 | 突触发生的调节 | IEA | 突触(GO期限:9) | - |
GO:0030252 | 生长激素分泌 | 塔斯 | 16511605 | |
去:0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号通路 | 艾达 | 8688086 | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0008343 | 成人喂养行为 | ISS | - | |
去:0009755 | 激素介导的信号传导 | 艾达 | 8688086 | |
去:0008154 | 肌动蛋白聚合或解聚 | 艾达 | 15232612 | |
GO:0032100 | 食欲的积极调节 | ISS | - | |
去:0040018 | 多细胞生物生长的阳性调节 | 小鬼 | 16511605 | |
GO:0032691 | 白介素-1β产生的负调节 | 艾达 | 15232612 | |
GO:0042536 | 肿瘤坏死因子生物合成过程的负调控 | 艾达 | 15232612 | |
GO:0050728 | 炎症反应的负调节 | 艾达 | 15232612 | |
GO:0043568 | 胰岛素样生长因子受体信号通路的正调控 | IEA | - | |
去:0046697 | 义词化 | 艾达 | 17494105 | |
GO:0045409 | 白介素-6生物合成过程的负调节 | 艾达 | 15232612 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0043005 | 神经元投影 | 艾达 | 神经元,轴突,神经突,树突(GO期限:5) | 12890514 |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0009986 | 细胞表面 | 艾达 | 8688086 | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0045121 | 膜筏 | 艾达 | 15232612 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |