基因页：nbea

Summary？
基因 26960
象征 nbea
Synonyms bcl8b | lyst2
Description Neurobeachin
参考erence MIM：604889|HGNC：HGNC：7648|ENSEMBL：ENSG00000172915|HPRD：05352|Vega：Otthumg0000000016724
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q13
Pascal P值 0.701
Sherlock p-value 0.597
胎儿β 1.168
DMG 1 (# studies)
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
CompositeSet
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标
潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献：0.1835

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
nbea CHR13 35683436 G 一个 NM_015678 p.564v> i missense Schizophrenia DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
cg19557340 13 35516445 nbea 2.292E-4 -0.302 0.036 DMG：Wockner_2014
cg13652338 13 36172439 mir548f5; nbea 3.852E-4 -0.679 0.043 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005488 捆绑 IEA -
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0012505 endomembrane system ISS -
GO:0005802 反式高尔基网络 ISS -
GO:0005829 细胞质 ISS -
去：0005737 cytoplasm IEA -
去：0005886 质膜 ISS -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP 1821年 933 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781 1082 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
PASQUALUCCI LYMPHOMA BY GC STAGE UP 283 177 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
XU GH1自分泌目标DN 142 94 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN 701 446 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
MCMURRAY TP53 HRAS COOPERATION RESPONSE DN 67 46 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP 101 66 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块 721 492 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
lu eszh2靶向DN 414 237 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR DN 91 56 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR DN 505 328 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Gabriely miR21靶标 289 187 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
双龙血清和雷帕霉素敏感基因 68 35 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-129-5p 1712年 1718年 1a HSA-MIR-129brain cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-130/301 672 678 M8 HSA-MIR-130Abrain cagugcaauguaaaaggggau
hsa-miR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130bbrain Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
miR-135 736 742 M8 HSA-MIR-135A UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
miR-137 1536 1543 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
miR-138 184 190 M8 HSA-MIR-138brain Agcugguuguguugaauc
mir-148/152 1442 1448 1a HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152brain UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
miR-153 1731年 1737 1a HSA-MIR-153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 674 680 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
hsa-miR-20abrain UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa-miR-106a 一个一个一个一个GUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa-miR-106bSZ UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20bSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
hsa-miR-20abrain UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa-miR-106a 一个一个一个一个GUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa-miR-106bSZ UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20bSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
miR-181 1282 1288 1a HSA-MIR-181Abrain 一个一个CAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181Cbrain AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181Dbrain aacauucauuguugucggggguggguu
mir-188 453 460 1A，M8 HSA-MIR-188 cucccuugcaugguggggu
mir-19 1368 1374 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir-190 1380 1387 1A，M8 HSA-MIR-190 UGAUAUGUUUGAUAUAUUAGGU
mir-194 336 342 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-203.1 1598年 1604 1a hsa-miR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-204/211 452 458 M8 hsa-miR-204brain UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU
hsa-miR-211 UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU
mir-21 1646 1652 1a hsa-miR-21brain UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA
hsa-miR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-218 38 44 1a hsa-miR-218brain UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
mir-330 351 357 1a hsa-miR-330brain GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
mir-331 1178 1184 M8 hsa-miR-331brain gccccugggccuauccuagaa
mir-342 1697年 1703 M8 hsa-miR-342brain ucucacacagaaaucgcacccccguc
miR-377 1696年 1702 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
miR-381 1212 1218 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-409-5p 1655 1661 1a HSA-MIR-409-5P Agguacccgagaacuuugca
mir-421 1266 1273 1A，M8 hsa-miR-421 ggccucauaauguuguug
mir-448 1730年 1737 1A，M8 hsa-miR-448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU
mir-485-5p 379 385 M8 hsa-miR-485-5p aggcuggccgugaugauuc
miR-488 1582 1588年 1a HSA-MIR-488 cccagauauggcacucucucaa
miR-493-5p 1241 1247 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
miR-494 1201 1207 M8 HSA-MIR-494brain ugaaacauacgggaaaccucuu
miR-496 1677 1683 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-500 562 568 M8 HSA-MIR-500 augcaccuggggaggagauucug
mir-539 1291 1297 1a hsa-miR-539 GG一个G一个一个一个UUAUCCUUGGUGUGU