基因页：PABPC1
概括？
| 基因 | 26986 |
| 象征 | PABPC1 |
| 同义词 | PAB1 | PABP | PABP1 | PABPC2 | PABPL1 |
| 描述 | 聚（A）结合蛋白，细胞质1 |
| 参考 | MIM：604679|HGNC：HGNC：8554|Ensembl：ENSG00000070756|HPRD：05247|Vega：Otthumg00000164779 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8Q22.2-Q23 |
| Pascal P值 | 0.626 |
| Sherlock P值 | 0.535 |
| 胎儿β | 0.849 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG05950485 | 8 | 101733214 | PABPC1 | 8.95e-9 | -0.007 | 4.09E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 塔达 | 0.93 | 0.93 |
| INTS7 | 0.93 | 0.93 |
| MCPH1 | 0.92 | 0.92 |
| DHX15 | 0.92 | 0.93 |
| RBBP4 | 0.92 | 0.91 |
| ZNF143 | 0.91 | 0.89 |
| XRN2 | 0.91 | 0.92 |
| KLHL7 | 0.91 | 0.92 |
| RBMX | 0.91 | 0.90 |
| Tex10 | 0.91 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.68 | -0.86 |
| AF347015.27 | -0.68 | -0.83 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.85 |
| FXYD1 | -0.67 | -0.85 |
| AF347015.31 | -0.67 | -0.83 |
| HLA-F | -0.67 | -0.76 |
| C5orf53 | -0.66 | -0.72 |
| AF347015.8 | -0.66 | -0.85 |
| ifi27 | -0.65 | -0.83 |
| mt-cyb | -0.65 | -0.82 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ANAPC5 | APC5 | 后期促进复合物亚基5 | - | HPRD，Biogrid | 15082755 |
| BCAR3 | KIAA0554 |NSP2 |SH2D3B | 乳腺癌抗雌激素抵抗3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| CNOT7 | CAF1 |HCAF-1 | CCR4不转录复合物，亚基7 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 18056425 |
| dynll1 | DLC1 |DLC8 |DNCL1 |DNClc1 |LC8 |LC8A |MGC126137 |MGC126138 |PIN |HDLC1 | Dynein，轻链，LC8型1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| EIF4A1 | ddx2a |EIF-4A |EIF4A | 真核翻译起始因子4a，同工型1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9548260 |
| EIF4A2 | BM-010 |ddx2b |EIF4A |EIF4F | 真核翻译起始因子4a，同工型2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| EIF4B | EIF-4B |Pro1843 | 真核翻译起始因子4b | - | HPRD，Biogrid | 11274152 |
| EIF4G1 | DKFZP686A1451 |EIF4F |EIF4G |P220 | 真核翻译起始因子4伽玛，1 | - | HPRD，Biogrid | 9857202 |
| ETF1 | D5S1995 |ERF |ERF1 |MGC111066 |RF1 |SUP45L1 |TB3-1 | 真核翻译终止因子1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 18056425 |
| GNB2L1 | GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白），β多肽2类样1 | - | HPRD，Biogrid | 12388589 |
| GSPT1 | 551G9.2 |ETF3A |FLJ38048 |FLJ39067 |GST1 |ERF3A | G1到S相变1 | - | HPRD，Biogrid | 10358005 |
| GSPT2 | FLJ10441 |GST2 |ERF3B | G1到S相变2 | - | HPRD，Biogrid | 10358005 |
| ikbke | ikk-i |ikke |ikki |KIAA0151 |MGC125294 |MGC125295 |MGC125297 | B细胞，激酶Epsilon中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PAIP1 | MGC12360 | 聚（A）结合蛋白相互作用蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 9548260|11997512 |
| PAIP2 | MGC72018 |paip2a | 聚（A）结合蛋白相互作用蛋白2 | - | HPRD，Biogrid | 11438674 |
| pan2 | FLJ39360 |KIAA0710 |USP52 |HPAN2 | PAN2 Polya特异性核糖核酸酶亚基同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD，Biogrid | 14583602 |
| pan3 | - | PAN3 Polya特异性核糖核酸酶亚基同源物（S. cerevisiae） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 18056425 |
| Pinx1 | FLJ20565 |lptl |lpts |MGC8850 | PIN2相互作用蛋白1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PUF60 | fir |FLJ31379 |robpi |siahbp1 | poly-U结合剪接因子60kDa | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PXN | FLJ16691 | 帕西林 | - | HPRD，Biogrid | 11704675 |
| SFRS12 | DKFZP564B176 |MGC133045 |SRRP508 |SRRP86 | 剪接因子，精氨酸/丝氨酸富集12 | - | HPRD | 14559993 |
| tob1 | Apro6 |MGC104792 |MGC34446 |Pig49 |tob |trob |trob1 | ERBB2的传感器，1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 18056425 |
| UPF1 | FLJ43809 |FLJ46894 |hupf1 |KIAA0221 |Norf1 |出租1 |PNORF1 | UPF1胡说笔录同源物（酵母）的调节剂 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 12723973 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta EIF4途径 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 盖结合复合物和EIF的结合后，mRNA的反应组激活，然后与43S结合 | 84 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome 3 UTR介导的翻译调节 | 176 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mRNA的反应元素化 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 | 53 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 | 176 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chandran转移Top50上升 | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 公园HSC vs多能祖先 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 纳德勒肥胖 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江龄大脑皮层 | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV 24小时DN | 91 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee转移和RNA处理 | 17 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C D | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 | 102 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜Kras致癌签名 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zembutsu对Nimustine的敏感性 | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zembutsu对黄胶的敏感性 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 艾布拉姆森与艾尔互动 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |