基因页：GJA3

概括？
基因 2700
象征 GJA3
同义词 ctrct14 | cx46 | czp3
描述 间隙连接蛋白α3
参考 MIM：121015|HGNC：HGNC：4277|ENSEMBL：ENSG00000121743|HPRD：00415|Vega：Otthumg0000000016510
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12.11
Pascal P值 0.724
胎儿β 0.028
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG19436414 13 20734680 GJA3 2.69E-9 -0.019 1.95E-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 9413992
去：0007601 视觉感知 塔斯 10205266
去：0006810 运输 nas 9413992
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005922 康纳克森复合物 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -
GO：0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Reactome膜贩运 129 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome间隙交界处贩运 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome间隙连接组件 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-182 494 501 1A，M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-185 388 394 1a HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
mir-96 495 501 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc