基因页面:CNPPD1
总结吗?
GeneID | 27013年 |
象征 | CNPPD1 |
同义词 | C2orf24 | CGI-57 |
描述 | 细胞周期蛋白Pas1 / PHO80域包含1 |
参考 | HGNC: HGNC: 25220|运用:ENSG00000115649|HPRD: 10780|织女:OTTHUMG00000133132 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 2 q35 |
帕斯卡假定值 | 5.51 e-5 |
夏洛克假定值 | 0.974 |
胎儿β | 0.48 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg21785260 | 2 | 220042096 | CNPPD1 | 6.81 e-11 | -0.014 | 4.34 e - | DMG: Jaffe_2016 |
cg01406341 | 2 | 220042724 | CNPPD1 | 1.43 e-9 | -0.022 | 1.39 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CNPPD1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
HORIUCHI WTAP目标了 | 306年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN UDAYAKUMAR MED1目标 | 240年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WAMUNYOKOLI卵巢癌LMP | 265年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲 | 479年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
詹多发性骨髓瘤CD2 | 45 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANOEVELEN肌发生SIN3A目标 | 220年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PECE乳腺干细胞 | 146年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 330 | 625年 | 631年 | m8 | hsa - mir - 330大脑 | GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA |
miR-7 | 533年 | 540年 | 1、m8 | hsa-miR-7深圳 | UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG |