基因页:DNAI1
概括?
基因 | 27019 |
象征 | DNAI1 |
同义词 | cild1 | dic1 | ICS1 | PCD |
描述 | 动力蛋白轴突中间链1 |
参考 | MIM:604366|HGNC:HGNC:2954|ENSEMBL:ENSG00000122735|HPRD:05080|Vega:Otthumg0000000019825 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p13.3 |
Pascal P值 | 0.057 |
胎儿β | -0.616 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14407698 | 9 | 3445886 | DNAI1 | 4.49e-8 | -0.008 | 1.23e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2098036 | CHR4 | 109269660 | DNAI1 | 27019 | 0.15 | 反式 | ||
RS6461405 | CHR7 | 19255956 | DNAI1 | 27019 | 0.06 | 反式 | ||
RS10958899 | Chr9 | 10128700 | DNAI1 | 27019 | 0.08 | 反式 | ||
RS10958907 | Chr9 | 10131580 | DNAI1 | 27019 | 0.07 | 反式 | ||
RS1322159 | Chr9 | 10132695 | DNAI1 | 27019 | 0.04 | 反式 | ||
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | DNAI1 | 27019 | 0.1 | 反式 | ||
RS7268640 | CHR20 | 47150267 | DNAI1 | 27019 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DNAI1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003774 | 运动活动 | 塔斯 | 10577904 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0030030 | 细胞投影组织 | IEA | 轴突(GO术语级别:7) | - |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | 塔斯 | 10577904 | |
去:0005874 | 微管 | IEA | - | |
去:0005929 | 纤毛 | 塔斯 | 10577904 | |
GO:0030286 | 动力蛋白复合物 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
突变的TP53 DN的Stambolsky靶标 | 50 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |