概括
基因 27019
象征 DNAI1
同义词 cild1 | dic1 | ICS1 | PCD
描述 动力蛋白轴突中间链1
参考 MIM:604366|HGNC:HGNC:2954|ENSEMBL:ENSG00000122735|HPRD:05080|Vega:Otthumg0000000019825
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9p13.3
Pascal P值 0.057
胎儿β -0.616
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14407698 9 3445886 DNAI1 4.49e-8 -0.008 1.23e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2098036 CHR4 109269660 DNAI1 27019 0.15 反式
RS6461405 CHR7 19255956 DNAI1 27019 0.06 反式
RS10958899 Chr9 10128700 DNAI1 27019 0.08 反式
RS10958907 Chr9 10131580 DNAI1 27019 0.07 反式
RS1322159 Chr9 10132695 DNAI1 27019 0.04 反式
RS10994209 Chr10 61877705 DNAI1 27019 0.1 反式
RS7268640 CHR20 47150267 DNAI1 27019 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003774 运动活动 塔斯 10577904
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0030030 细胞投影组织 IEA 轴突(GO术语级别:7) -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005856 细胞骨架 塔斯 10577904
去:0005874 微管 IEA -
去:0005929 纤毛 塔斯 10577904
GO:0030286 动力蛋白复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Huntingtons病 185 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
突变的TP53 DN的Stambolsky靶标 50 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因