基因页：NPTN
Summary？
| GeneID | 27020 |
| Symbol | NPTN |
| 同义词 | gp55 | gp65 | sdfr1 | sdr1 | np55 | np65 |
| 描述 | 神经塑料 |
| 参考 | MIM：612820|HGNC：HGNC：17867|ENSEMBL：ENSG00000156642|HPRD:18033|Vega:OTTHUMG00000137586 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q22 |
| Pascal P值 | 0.791 |
| Sherlock P值 | 0.65 |
| 胎儿β | -1.421 |
| 支持 | 细胞粘附和透射信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS CompositeSet |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 2 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0050839 | 细胞粘附分子结合 | ISS | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO:0048170 | 长期神经元突触可塑性的阳性调节 | ISS | 神经元，神经发生，突触（GO术语级别：11） | - |
| 去：0007156 | 同粒细胞粘附 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0042734 | presynaptic membrane | ISS | 神经元，轴突，突触（GO术语级别：5） | - |
| GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
部分诉通路注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124.1 | 127 | 133 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-124/506 | 127 | 133 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-130/301 | 730 | 736 | M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-146 | 927 | 933 | 1a | HSA-MIR-146A | ugagaacugaauuccaugggug |
| HSA-MIR-146B脑 | ugagaacugaauuccauaggcu | ||||
| mir-148/152 | 731 | 738 | 1A，M8 | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| mir - 150 | 455 | 461 | 1a | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
| mir-153 | 840 | 847 | 1A，M8 | HSA-MIR-153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| mir-181 | 226 | 232 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-185 | 81 | 87 | M8 | HSA-MIR-185脑 | Uggagaaaggcaguuc |
| mir-19 | 729 | 735 | M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir-214 | 499 | 505 | 1a | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
| mir-217 | 655 | 661 | 1a | HSA-MIR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
| miR-25/32/92/363/367 | 987 | 993 | M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
| HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
| HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
| HSA-MIR-367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
| mir-27 | 223 | 229 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-448 | 841 | 847 | 1a | hsa-miR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
| miR-494 | 484 | 490 | 1a | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |
| miR-495 | 248 | 254 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
| miR-496 | 709 | 716 | 1A，M8 | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
| mir-543 | 227 | 233 | M8 | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |
| HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu | ||||