概括
基因 27030
象征 MLH3
同义词 HNPCC7
描述 MUTL同源物3
参考 MIM:604395|HGNC:HGNC:7128|ENSEMBL:ENSG00000119684|HPRD:05094|Vega:Otthumg00000171766
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q24.3
Pascal P值 0.467
胎儿β 0.747
DMG 1(#研究)
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04798158 14 75179846 MLH3 9.355e-4 6.262 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
mical1 0.87 0.84
ZNF311 0.86 0.86
ZNF133 0.86 0.83
Adamts10 0.86 0.82
b4galnt4 0.85 0.82
PLSCR3 0.85 0.81
纳格 0.84 0.84
ankzf1 0.84 0.82
RBM5 0.84 0.83
qtrt1 0.84 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.64 -0.71
FBXO2 -0.62 -0.66
CA4 -0.62 -0.75
aldoc -0.62 -0.70
pth1r -0.61 -0.68
CSRP1 -0.60 -0.71
tinagl1 -0.60 -0.68
C5orf53 -0.60 -0.70
PTGD -0.60 -0.69
LDHD -0.60 -0.65

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003682 染色质结合 IEA -
去:0003696 卫星DNA结合 塔斯 10615123
去:0005515 蛋白质结合 nas 12095912
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0030983 不匹配的DNA结合 IEA -
GO:0019237 丝粒DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007130 突发型复合体组件 IEA 突触(GO期限:11) -
去:0007131 相互减数分裂重组 nas 12095912
去:0007140 男性减数分裂 IEA -
去:0007144 女性减数分裂i IEA -
去:0006298 不匹配维修 IEA -
去:0006298 不匹配维修 nas 12095912
去:0008104 蛋白质定位 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000793 冷凝染色体 IEA -
去:0000795 突发型复合体 IEA -
去:0005634 塔斯 10615123
去:0005712 chiasma IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG不匹配维修 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂 116 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂重组 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王攀登目标 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gnatenko血小板签名 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk减数分裂和DNA修复 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK精子细胞 72 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
raghavachari血小板特异性基因 70 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 2小时DN的响应 55 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因