基因页:MLH3
概括?
基因 | 27030 |
象征 | MLH3 |
同义词 | HNPCC7 |
描述 | MUTL同源物3 |
参考 | MIM:604395|HGNC:HGNC:7128|ENSEMBL:ENSG00000119684|HPRD:05094|Vega:Otthumg00000171766 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q24.3 |
Pascal P值 | 0.467 |
胎儿β | 0.747 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04798158 | 14 | 75179846 | MLH3 | 9.355e-4 | 6.262 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MLH3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
mical1 | 0.87 | 0.84 |
ZNF311 | 0.86 | 0.86 |
ZNF133 | 0.86 | 0.83 |
Adamts10 | 0.86 | 0.82 |
b4galnt4 | 0.85 | 0.82 |
PLSCR3 | 0.85 | 0.81 |
纳格 | 0.84 | 0.84 |
ankzf1 | 0.84 | 0.82 |
RBM5 | 0.84 | 0.83 |
qtrt1 | 0.84 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.64 | -0.71 |
FBXO2 | -0.62 | -0.66 |
CA4 | -0.62 | -0.75 |
aldoc | -0.62 | -0.70 |
pth1r | -0.61 | -0.68 |
CSRP1 | -0.60 | -0.71 |
tinagl1 | -0.60 | -0.68 |
C5orf53 | -0.60 | -0.70 |
PTGD | -0.60 | -0.69 |
LDHD | -0.60 | -0.65 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003682 | 染色质结合 | IEA | - | |
去:0003696 | 卫星DNA结合 | 塔斯 | 10615123 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | nas | 12095912 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0030983 | 不匹配的DNA结合 | IEA | - | |
GO:0019237 | 丝粒DNA结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007130 | 突发型复合体组件 | IEA | 突触(GO期限:11) | - |
去:0007131 | 相互减数分裂重组 | nas | 12095912 | |
去:0007140 | 男性减数分裂 | IEA | - | |
去:0007144 | 女性减数分裂i | IEA | - | |
去:0006298 | 不匹配维修 | IEA | - | |
去:0006298 | 不匹配维修 | nas | 12095912 | |
去:0008104 | 蛋白质定位 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000793 | 冷凝染色体 | IEA | - | |
去:0000795 | 突发型复合体 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 10615123 | |
去:0005712 | chiasma | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG不匹配维修 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂重组 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gnatenko血小板签名 | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk减数分裂和DNA修复 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK精子细胞 | 72 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
raghavachari血小板特异性基因 | 70 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 2小时DN的响应 | 55 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |