概括
基因 27037
象征 trmt2a
同义词 HTF9C
描述 tRNA甲基转移酶2同源物A
参考 MIM:611151|HGNC:HGNC:24974|Ensembl:ENSG0000000099899|HPRD:13719|Vega:Otthumg00000150454
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q11.21
Pascal P值 5.986E-4
胎儿β -0.349

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C17orf42 0.80 0.86
CYP2R1 0.79 0.86
GLT8D1 0.79 0.85
C4ORF27 0.78 0.86
COQ3 0.78 0.84
Nae1 0.78 0.85
C7orf36 0.78 0.87
trnau1ap 0.78 0.84
FRG1 0.77 0.83
ACAT1 0.77 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.15 -0.67 -0.74
AF347015.2 -0.67 -0.75
MT-CO2 -0.67 -0.70
mt-cyb -0.66 -0.72
AF347015.8 -0.66 -0.72
AF347015.26 -0.66 -0.76
AF347015.27 -0.66 -0.70
AF347015.33 -0.64 -0.69
AF347015.31 -0.62 -0.68
AIFM3 -0.61 -0.65

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 IEA -
去:0008168 甲基转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008152 代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN 20 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOXA9和MEIS1的赫斯目标 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因