基因页:trmt2a
概括?
基因 | 27037 |
象征 | trmt2a |
同义词 | HTF9C |
描述 | tRNA甲基转移酶2同源物A |
参考 | MIM:611151|HGNC:HGNC:24974|Ensembl:ENSG0000000099899|HPRD:13719|Vega:Otthumg00000150454 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22Q11.21 |
Pascal P值 | 5.986E-4 |
胎儿β | -0.349 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRMT2A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C17orf42 | 0.80 | 0.86 |
CYP2R1 | 0.79 | 0.86 |
GLT8D1 | 0.79 | 0.85 |
C4ORF27 | 0.78 | 0.86 |
COQ3 | 0.78 | 0.84 |
Nae1 | 0.78 | 0.85 |
C7orf36 | 0.78 | 0.87 |
trnau1ap | 0.78 | 0.84 |
FRG1 | 0.77 | 0.83 |
ACAT1 | 0.77 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.15 | -0.67 | -0.74 |
AF347015.2 | -0.67 | -0.75 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.70 |
mt-cyb | -0.66 | -0.72 |
AF347015.8 | -0.66 | -0.72 |
AF347015.26 | -0.66 | -0.76 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.70 |
AF347015.33 | -0.64 | -0.69 |
AF347015.31 | -0.62 | -0.68 |
AIFM3 | -0.61 | -0.65 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003723 | RNA结合 | IEA | - | |
去:0008168 | 甲基转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN | 20 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOXA9和MEIS1的赫斯目标 | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G2 | 182 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |