基因页面:SND1
总结吗?
| GeneID | 27044年 |
| 象征 | SND1 |
| 同义词 | TDRD11 | p100 |
| 描述 | 葡萄球菌核酸酶和都铎域包含1 |
| 参考 | MIM: 602181|HGNC: HGNC: 30646|运用:ENSG00000197157|HPRD: 03714|织女:OTTHUMG00000157560 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 q31.3 |
| 帕斯卡假定值 | 8.566的军医 |
| 夏洛克假定值 | 0.789 |
| 胎儿β | -0.277 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 小脑 皮质 硬膜基底神经节 |
| 支持 | G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SND1 | chr7 | 127347673 | 一个 | G | NM_014390 | p.337D > G | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg20108872 | 7 | 127595297 | SND1 | 1.55 e-5 | 0.569 | 0.015 | DMG: Wockner_2014 |
| cg05986781 | 7 | 127291658 | SND1 | 4.08 e-9 | -0.019 | 2.49 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs35660964 | 7 | 127272820 | SND1 | ENSG00000197157.6 | 3.58193 e-6 | 0.03 | -19414年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs73234873 | 7 | 127292004 | SND1 | ENSG00000197157.6 | 3.30934 e-6 | 0.03 | -230年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13238924 | 7 | 127363060 | SND1 | ENSG00000197157.6 | 3.30051 e-6 | 0.03 | 70826年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1348103 | 7 | 127391852 | SND1 | ENSG00000197157.6 | 3.30129 e-6 | 0.03 | 99618年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID CMYB通路 | 84年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ENK紫外线反应角化细胞 | 530年 | 342年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BERENJENO改变了RHOA DN | 394年 | 258年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 前列腺癌·汤姆林了 | 40 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 英格拉姆嘘DN的目标 | 64年 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢泼德BMYB吗啉代了 | 205年 | 126年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁尼回应TRABECTEDIN | 50 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SESTO应对紫外线C6 | 39 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KAAB心脏心房和心室 | 249年 | 170年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐gh外源目标 | 85年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STEARMAN肺癌早期和晚期DN | 61年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SARRIO上皮间充质转变 | 154年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN | 354年 | 216年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 气浆细胞瘤DN | One hundred. | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN YOSHIMURA MAPK8目标 | 366年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的肺癌喀斯特 | 491年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的喀斯特致癌签名 | 89年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群14 | 143年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |