基因页:PPA2
概括?
基因 | 27068 |
象征 | PPA2 |
同义词 | HSPC124 | SID6-306 |
描述 | 焦磷酸酶(无机)2 |
参考 | MIM:609988|HGNC:HGNC:28883|ENSEMBL:ENSG00000138777|HPRD:18494|Vega:Otthumg00000128781 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q25 |
Pascal P值 | 0.21 |
Sherlock P值 | 0.921 |
胎儿β | -0.794 |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9942141 | CHR4 | 106255111 | PPA2 | 27068 | 0 | 顺式 | ||
RS2647259 | CHR4 | 106256520 | PPA2 | 27068 | 0.13 | 顺式 | ||
RS2726486 | CHR4 | 106264680 | PPA2 | 27068 | 0.14 | 顺式 | ||
RS3898404 | CHR4 | 106356394 | PPA2 | 27068 | 0.01 | 顺式 | ||
RS4698944 | CHR4 | 106438439 | PPA2 | 27068 | 0.16 | 顺式 | ||
RS10026456 | CHR4 | 106442585 | PPA2 | 27068 | 0.11 | 顺式 | ||
RS7686705 | CHR4 | 106465144 | PPA2 | 27068 | 0.13 | 顺式 | ||
RS2866799 | CHR4 | 106474974 | PPA2 | 27068 | 0.06 | 顺式 | ||
SNP_A-2205640 | 0 | PPA2 | 27068 | 0.14 | 反式 | |||
RS9942141 | CHR4 | 106255111 | PPA2 | 27068 | 0.1 | 反式 | ||
SNP_A-1897043 | 0 | PPA2 | 27068 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPA2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome线粒体tRNA氨基酰化 | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome tRNA氨基酰化 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mayburd对L663536 DN的反应 | 56 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GON GON BLOOD HDL胆固醇QTL顺式 | 13 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黑川肝癌化学疗法 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |