基因页:GHITM
概括?
基因 | 27069 |
象征 | GHITM |
同义词 | derp2 | hspc282 | mics1 | my021 | ptd010 | tmbim5 |
描述 | 生长激素诱导的跨膜蛋白 |
参考 | HGNC:HGNC:17281|ENSEMBL:ENSG00000165678|HPRD:17038|Vega:Otthumg0000000018637 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q23.1 |
Pascal P值 | 0.124 |
Sherlock P值 | 0.084 |
胎儿β | -0.898 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25186695 | 10 | 85899272 | GHITM | 3.729E-4 | -0.255 | 0.043 | DMG:Wockner_2014 |
CG03102306 | 10 | 85899580 | GHITM | 4.14e-8 | -0.009 | 1.16e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GHITM_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DPYSL3 | 0.88 | 0.93 |
ccnj | 0.88 | 0.91 |
asxl1 | 0.88 | 0.93 |
MTSS1 | 0.88 | 0.92 |
CASP2 | 0.88 | 0.90 |
AL033532.1 | 0.87 | 0.89 |
JUP | 0.87 | 0.87 |
PLXNA3 | 0.87 | 0.91 |
PARP16 | 0.87 | 0.90 |
ST8SIA2 | 0.87 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.68 | -0.79 |
C5orf53 | -0.67 | -0.77 |
AIFM3 | -0.66 | -0.76 |
aldoc | -0.66 | -0.70 |
S100B | -0.65 | -0.84 |
FBXO2 | -0.65 | -0.64 |
AF347015.31 | -0.64 | -0.89 |
TSC22D4 | -0.64 | -0.79 |
AF347015.27 | -0.64 | -0.87 |
LHPP | -0.64 | -0.61 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
约翰逊脑癌早期与晚期DN | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tseng脂肪势DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Demagalhaes老化DN | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇5 dn | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 | 145 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |