概括
基因 27075
象征 TSPAN13
同义词 net-6 | net6 | tm4​​sf13
描述 四翼胺13
参考 MIM:613139|HGNC:HGNC:21643|ENSEMBL:ENSG00000106537|HPRD:15510|Vega:Otthumg0000000022968
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p21.1
Pascal P值 0.155
Sherlock P值 0.937
胎儿β 0.131
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG12567315 7 16793634 TSPAN13 7.17e-8 -0.007 1.72E-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 TSPAN13 27075 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
WDR44 0.86 0.89
gnptab 0.85 0.90
IBTK 0.85 0.88
C2orf37 0.84 0.87
pank3 0.84 0.90
FAM13B 0.84 0.86
BHLHB9 0.84 0.87
fktn 0.84 0.88
MAP4K3 0.84 0.88
C3orf63 0.84 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.70 -0.78
AF347015.31 -0.70 -0.78
FXYD1 -0.69 -0.76
AF347015.8 -0.69 -0.78
AF347015.27 -0.68 -0.76
AF347015.33 -0.68 -0.74
mt-cyb -0.67 -0.75
higd1b -0.66 -0.76
AF347015.15 -0.66 -0.75
AF347015.2 -0.66 -0.74

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌 96 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola Sezary综合征DN 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN 90 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨乳腺癌ESR1大量 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU细胞迁移 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 83 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟 116 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌簇6 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因