概括
基因 27086
象征 FOXP1
同义词 12cc4 | hspc215 | mfh | qrf1 | hfkh1b
描述 叉子盒P1
参考 MIM:605515|HGNC:HGNC:3823|ENSEMBL:ENSG00000114861|HPRD:18518|Vega:Otthumg00000158803
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P14.1
Pascal P值 5.045e-9
Sherlock P值 0.836
胎儿β 0.06
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.04047
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.04359
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.87
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24980458 3 71632677 FOXP1 -0.02 0.41 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2033050 CHR7 134933767 FOXP1 27086 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MRTO4 0.79 0.79
纳尔夫 0.78 0.78
CDK10 0.78 0.79
NCAPH2 0.77 0.80
Rab24 0.77 0.77
Pick1 0.77 0.76
TTLL3 0.77 0.77
STK25 0.76 0.76
ring1 0.76 0.77
PNKP 0.76 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.2 -0.64 -0.59
AF347015.8 -0.63 -0.58
AF347015.15 -0.62 -0.59
AF347015.31 -0.62 -0.58
mt-cyb -0.62 -0.59
AF347015.27 -0.61 -0.59
MT-ATP8 -0.61 -0.63
AF347015.26 -0.60 -0.59
MT-CO2 -0.60 -0.54
AF347015.33 -0.59 -0.56

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 IEA -
去:0003705 RNA聚合酶II转录因子活性,增强子结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0016566 特定的转录阻遏活性 IEA -
GO:0042803 蛋白质同构化活性 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
GO:0046982 蛋白质异二聚化活性 IEA -
GO:0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007519 骨骼肌发育 IEA 神经元(GO期限:8) -
GO:0000122 RNA聚合酶II启动子的转录负调控 IEA -
去:0002639 免疫球蛋白产生的阳性调节 IEA -
去:0002053 间充质细胞增殖的阳性调节 IEA -
去:0002329 前B细胞分化 IEA -
去:0055007 心肌细胞分化 IEA -
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0009790 胚胎发展 IEA -
去:0007507 心脏发展 IEA -
GO:0016481 转录的负调节 IEA -
GO:0033152 免疫球蛋白V(D)J重组 IEA -
GO:0030324 肺发展 IEA -
GO:0048745 平滑肌发育 IEA -
去:0050679 上皮细胞增殖的阳性调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005730 核仁 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤DN 136 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues DCC目标DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性洛夫 115 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向DN 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
汉·詹克(Han Jnk)唱歌 35 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
safford t淋巴细胞厌食 87 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3 t淋巴细胞DN中的靶标 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen去分化状态DN 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标DN 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Asgharzadeh神经母细胞瘤生存率差DN 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇0的时间反应0 76 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF持续DN 61 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 773 779 1a HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-132/212 2697 2703 1a HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
HSA-MIR-132 uaacagucuacccaugggg
mir-139 2808 2814 M8 HSA-MIR-139 ucuacagugcacgugucu
mir-141/200a 282 288 M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-150 172 178 M8 HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-181 705 711 M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-183 153 159 M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-19 439 446 1A,M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-191 823 829 M8 HSA-MIR-191 caacggaaucccaaaagcagcu
mir-22 2523 2529 M8 HSA-MIR-22 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-221/222 2810 2816 1a HSA-MIR-221 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-30-3p 2886 2893 1A,M8 HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-324-3p 71 77 1a HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
mir-329 540 546 1a HSA-MIR-329 aacacaccugguaaccucuuu
mir-33 1356 1362 1a HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-34/449 465 471 M8 HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-34b 466 472 M8 HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
mir-369-3p 725 731 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 725 731 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-409-3p 819 825 M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-543 706 713 1A,M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-9 1730年 1737年 1A,M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga