基因页：B3GAT1

概括？
基因 27087
象征 B3GAT1
同义词 CD57 | glcatp | glcuatp | hnk1 | leu7 | nk-1 | nk1
描述 beta-1,3-葡萄糖lunylranyltransferase 1
参考 MIM：151290|HGNC：HGNC：921|Ensembl：ENSG00000109956|HPRD：06969|Vega：Otthumg00000167180
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11Q25
Pascal P值 3.036E-5
Sherlock P值 0.017
胎儿β 0.13
DMG 2（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 2
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG23596233 11 134281663 B3GAT1 9.89e-8 -0.009 2.2e-5 DMG：JAFFE_2016
CG19674669 11 134146910 B3GAT1 0.002 4.559 DMG：Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12528509 CHR6 51390611 B3GAT1 27087 0.08 反式
RS12528978 CHR6 51391613 B3GAT1 27087 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SS18L1 0.96 0.95
GPR173 0.95 0.94
KDM4B 0.95 0.94
ZNF398 0.95 0.95
PFKFB4 0.94 0.93
ZNF74 0.94 0.93
KDM2B 0.94 0.95
BCORL1 0.94 0.93
BCL9 0.94 0.95
sema4c 0.94 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.72 -0.78
AF347015.31 -0.71 -0.89
AF347015.27 -0.70 -0.88
AIFM3 -0.70 -0.74
MT-CO2 -0.70 -0.89
S100B -0.69 -0.81
HLA-F -0.68 -0.72
AF347015.33 -0.68 -0.84
FXYD1 -0.68 -0.84
ifi27 -0.67 -0.84

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
去：0008499 UDP-半乳糖：β-N-乙酰葡萄糖胺β-1,3-半乳糖基转移酶活性活性 IEA -
去：0015018 半乳糖基乳糖基糖基蛋白3β-葡萄糖基转移酶活性 IEA -
GO：0030145 锰离子结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005975 碳水化合物代谢过程 塔斯 10783264
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000139 高尔基膜 IEA -
去：0005794 高尔基体 IEA -
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 塔斯 10783264

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG糖胺聚糖生物合成软骨素硫酸盐 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG糖胺聚糖生物合成乙par硫酸盐 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome硫酸乙酰肝素肝素HS GAG代谢 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GAG合成需要四糖接头序列 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Hyppocampus 22Q11删除 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Brain 22Q11删除 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-149 763 769 M8 HSA-MIR-149脑 Ucuggcuccucuucuucacuccc
mir-218 1379年 1386 1A，M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu