概括
基因 27095
象征 trappc3
同义词 Bet3
描述 运输蛋白颗粒复合物3
参考 MIM:610955|HGNC:HGNC:19942|Ensembl:ENSG00000054116|HPRD:11644|Vega:Otthumg00000007664
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p34.3
Pascal P值 2.719E-5
Sherlock P值 0.003
胎儿β -0.337
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PARP4 0.66 0.56
MSN 0.65 0.48
FAM114A1 0.62 0.52
M6PRBP1 0.62 0.57
sall1 0.61 0.49
9月10日 0.61 0.46
yap1 0.61 0.55
BTN2A2 0.59 0.51
Sult1c4 0.59 0.56
SLC2A10 0.59 0.43
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
IER5L -0.29 -0.27
GPR22 -0.26 -0.26
SLC26A4 -0.26 -0.26
C3orf54 -0.24 -0.24
LMO7 -0.24 -0.16
LRFN2 -0.24 -0.21
TTC9B -0.24 -0.30
klhl1 -0.24 -0.17
RPRM -0.23 -0.23
mpped1 -0.23 -0.21

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞短期 32 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
抗原表现中的Pellicciotta HDAC 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因