基因页:trappc3
概括?
基因 | 27095 |
象征 | trappc3 |
同义词 | Bet3 |
描述 | 运输蛋白颗粒复合物3 |
参考 | MIM:610955|HGNC:HGNC:19942|Ensembl:ENSG00000054116|HPRD:11644|Vega:Otthumg00000007664 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p34.3 |
Pascal P值 | 2.719E-5 |
Sherlock P值 | 0.003 |
胎儿β | -0.337 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRAPPC3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PARP4 | 0.66 | 0.56 |
MSN | 0.65 | 0.48 |
FAM114A1 | 0.62 | 0.52 |
M6PRBP1 | 0.62 | 0.57 |
sall1 | 0.61 | 0.49 |
9月10日 | 0.61 | 0.46 |
yap1 | 0.61 | 0.55 |
BTN2A2 | 0.59 | 0.51 |
Sult1c4 | 0.59 | 0.56 |
SLC2A10 | 0.59 | 0.43 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
IER5L | -0.29 | -0.27 |
GPR22 | -0.26 | -0.26 |
SLC26A4 | -0.26 | -0.26 |
C3orf54 | -0.24 | -0.24 |
LMO7 | -0.24 | -0.16 |
LRFN2 | -0.24 | -0.21 |
TTC9B | -0.24 | -0.30 |
klhl1 | -0.24 | -0.17 |
RPRM | -0.23 | -0.23 |
mpped1 | -0.23 | -0.21 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞短期 | 32 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
抗原表现中的Pellicciotta HDAC | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |