概括
基因 27124
象征 inpp5j
同义词 inpp5 | pib5pa | pipp
描述 肌醇聚磷酸5-磷酸酶J
参考 MIM:606481|HGNC:HGNC:8956|ENSEMBL:ENSG00000185133|HPRD:07573|Vega:Otthumg00000151206
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q12.2
Pascal P值 0.007
Sherlock P值 2.433e-5
胎儿β -1.078

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004437 肌醇或磷脂酰肌醇磷酸酶活性 IEA -
去:0004445 肌醇 - 聚磷酸5-磷酸酶活性 IEA -
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
GO:0017124 SH3域结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001726 荷叶边 艾达 12536145
去:0005737 细胞质 艾达 12536145

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG肌醇磷酸代谢 54 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 76 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
质膜上的PIP的反应组合成 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pi代谢 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管DN 114 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨乳腺癌ESR1大量 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对雌二醇DN的反应 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标2WK 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脑DN中的乳腺癌复发 85 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRA与基质刺激DN 99 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS ICP带有H3K27Me3 54 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN 91 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 166 172 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-15/16/195/424/497 75 81 M8 HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-219 171 178 1A,M8 HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-27 166 172 M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc