基因页:inpp5j
概括?
基因 | 27124 |
象征 | inpp5j |
同义词 | inpp5 | pib5pa | pipp |
描述 | 肌醇聚磷酸5-磷酸酶J |
参考 | MIM:606481|HGNC:HGNC:8956|ENSEMBL:ENSG00000185133|HPRD:07573|Vega:Otthumg00000151206 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q12.2 |
Pascal P值 | 0.007 |
Sherlock P值 | 2.433e-5 |
胎儿β | -1.078 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/INPP5J_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004437 | 肌醇或磷脂酰肌醇磷酸酶活性 | IEA | - | |
去:0004445 | 肌醇 - 聚磷酸5-磷酸酶活性 | IEA | - | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
GO:0017124 | SH3域结合 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001726 | 荷叶边 | 艾达 | 12536145 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 12536145 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG肌醇磷酸代谢 | 54 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
质膜上的PIP的反应组合成 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pi代谢 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
留置权乳腺癌化生型与导管DN | 114 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨乳腺癌ESR1大量 | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Frasor对雌二醇DN的反应 | 82 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌转移 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Delta FOSB目标2WK | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脑DN中的乳腺癌复发 | 85 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼中的Smid乳腺癌复发 | 97 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 UP | 167 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist NRA与基质刺激DN | 99 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS ICP带有H3K27Me3 | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时DN | 91 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-128 | 166 | 172 | 1a | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
mir-15/16/195/424/497 | 75 | 81 | M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
mir-219 | 171 | 178 | 1A,M8 | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
mir-27 | 166 | 172 | M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc |