基因页:IL36b
概括?
基因 | 27177 |
象征 | IL36b |
同义词 | FIL1 | FIL1-(ETA)| FIL1H | FILI-(ETA)| IL-1F8 | IL-1H2 | IL1-ETA | IL1F8 | IL1H2 |
描述 | Interleukin 36,Beta |
参考 | MIM:605508|HGNC:HGNC:15564|Ensembl:ENSG00000136696|HPRD:05694|Vega:Otthumg00000131338 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2Q14 |
Pascal P值 | 0.748 |
胎儿β | -0.061 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
IL36b | CHR2 | 113788640 | G | 一种 | NM_014438 NM_173178 |
p.36r> c p.36r> c |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7370564 | 0 | IL1F8 | 27177 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IL36B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ACD | 0.94 | 0.94 |
ZNF446 | 0.93 | 0.93 |
C7orf27 | 0.93 | 0.90 |
USP21 | 0.93 | 0.91 |
Telo2 | 0.93 | 0.92 |
Med16 | 0.92 | 0.91 |
GTPBP3 | 0.92 | 0.94 |
ZNF574 | 0.92 | 0.91 |
PTOV1 | 0.92 | 0.92 |
ZNF408 | 0.92 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.73 | -0.84 |
AF347015.31 | -0.71 | -0.82 |
MT-CO2 | -0.71 | -0.82 |
AF347015.33 | -0.70 | -0.80 |
AF347015.8 | -0.70 | -0.84 |
mt-cyb | -0.69 | -0.82 |
AF347015.15 | -0.67 | -0.80 |
C5orf53 | -0.65 | -0.69 |
AF347015.2 | -0.65 | -0.80 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.85 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005149 | 白介素-1受体结合 | nas | 10744718 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006955 | 免疫反应 | nas | 10744718 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 塔斯 | 10744718 | |
去:0005615 | 细胞外空间 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向DN | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matthews皮肤致癌作用 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
绅士白血病干细胞DN | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |