概括
基因 27177
象征 IL36b
同义词 FIL1 | FIL1-(ETA)| FIL1H | FILI-(ETA)| IL-1F8 | IL-1H2 | IL1-ETA | IL1F8 | IL1H2
描述 Interleukin 36,Beta
参考 MIM:605508|HGNC:HGNC:15564|Ensembl:ENSG00000136696|HPRD:05694|Vega:Otthumg00000131338
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2Q14
Pascal P值 0.748
胎儿β -0.061
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
IL36b CHR2 113788640 G 一种 NM_014438
NM_173178
p.36r> c
p.36r> c
错过
错过
精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7370564 0 IL1F8 27177 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ACD 0.94 0.94
ZNF446 0.93 0.93
C7orf27 0.93 0.90
USP21 0.93 0.91
Telo2 0.93 0.92
Med16 0.92 0.91
GTPBP3 0.92 0.94
ZNF574 0.92 0.91
PTOV1 0.92 0.92
ZNF408 0.92 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.73 -0.84
AF347015.31 -0.71 -0.82
MT-CO2 -0.71 -0.82
AF347015.33 -0.70 -0.80
AF347015.8 -0.70 -0.84
mt-cyb -0.69 -0.82
AF347015.15 -0.67 -0.80
C5orf53 -0.65 -0.69
AF347015.2 -0.65 -0.80
AF347015.21 -0.64 -0.85

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005149 白介素-1受体结合 nas 10744718
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006955 免疫反应 nas 10744718
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 塔斯 10744718
去:0005615 细胞外空间 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向DN 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matthews皮肤致癌作用 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
绅士白血病干细胞DN 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因