基因页：AMPD3
Summary？
| 基因 | 272 |
| 象征 | AMPD3 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 腺苷一磷酸脱氨酶3 |
| 参考 | MIM：102772|HGNC：HGNC：470|ENSEMBL：ENSG00000133805|HPRD：00041|Vega：Otthumg00000165682 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11p15 |
| Pascal P值 | 0.661 |
| Sherlock P值 | 0.085 |
| 胎儿β | -2.086 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
部分即遗传学和表观遗传学notation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26489413 | 11 | 10476976 | AMPD3 | 4.81E-6 | -0.598 | 0.01 | DMG：Wockner_2014 |
| CG07329251 | 11 | 10476662 | AMPD3 | 6.03e-5 | -0.586 | 0.023 | DMG：Wockner_2014 |
| CG19132462 | 11 | 10476608 | AMPD3 | 1.019E-4 | -0.585 | 0.028 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11042789 | Chr11 | 10434408 | AMPD3 | 272 | 0.17 | 顺式 | ||
| RS9971562 | 11 | 10464659 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 3.93e-8 | 0 | 134799 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs398075716 | 11 | 10466453 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 1.836E-8 | 0 | 136593 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11605232 | 11 | 10468501 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 7.128e-7 | 0 | 138641 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11604780 | 11 | 10468671 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 5.752e-8 | 0 | 138811 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11606703 | 11 | 10468712 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 3.013E-7 | 0 | 138852 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11602632 | 11 | 10468724 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 5.994e-8 | 0 | 138864 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11604833 | 11 | 10468906 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 5.987E-8 | 0 | 139046 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11604838 | 11 | 10468953 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 5.985e-8 | 0 | 139093 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7929999 | 11 | 10470440 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 3.003E-7 | 0 | 140580 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6484290 | 11 | 10470852 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 2.975E-7 | 0 | 140992 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7112321 | 11 | 10471218 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 2.967E-7 | 0 | 141358 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7111970 | 11 | 10471680 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 1.143E-7 | 0 | 141820 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11042811 | 11 | 10473889 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 1.494E-7 | 0 | 144029 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11042812 | 11 | 10474010 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 1.419E-9 | 0 | 144150 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS200902109 | 11 | 10474496 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 3.765e-7 | 0 | 144636 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61264398 | 11 | 10474497 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 5.73E-9 | 0 | 144637 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2071020 | 11 | 10478228 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 2.771E-7 | 0 | 148368 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS936514 | 11 | 10481613 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 3.651E-9 | 0 | 151753 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS936513 | 11 | 10481667 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 3.7e-9 | 0 | 151807 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10840420 | 11 | 10490415 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 3.788e-9 | 0 | 160555 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10840422 | 11 | 10491741 | AMPD3 | ENSG00000133805.11 | 1.849E-6 | 0 | 161881 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Acadvl | 0.77 | 0.79 |
| TTC7A | 0.70 | 0.68 |
| MYO15B | 0.69 | 0.66 |
| SLC27A1 | 0.68 | 0.70 |
| Pilrb | 0.67 | 0.64 |
| 拉特 | 0.67 | 0.61 |
| MYO15B | 0.67 | 0.66 |
| PLD2 | 0.67 | 0.73 |
| Col11a2 | 0.66 | 0.66 |
| AC010618.2 | 0.65 | 0.66 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| gucy1a2 | -0.42 | -0.42 |
| ppm1l | -0.39 | -0.33 |
| lin7a | -0.39 | -0.39 |
| MAPK6 | -0.38 | -0.36 |
| lass6 | -0.38 | -0.34 |
| HSPA13 | -0.37 | -0.37 |
| MOBKL3 | -0.37 | -0.40 |
| LMBRD2 | -0.37 | -0.39 |
| DOK6 | -0.37 | -0.36 |
| zyg11b | -0.37 | -0.33 |