基因页：GLB1
概括？
| 基因 | 2720 |
| 象征 | GLB1 |
| 同义词 | EBP | ELNR1 | MPS4B |
| 描述 | 半乳糖苷酶β1 |
| 参考 | MIM：611458|HGNC：HGNC：4298|ENSEMBL：ENSG00000170266|HPRD：01975|Vega：Otthumg00000155781 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P21.33 |
| Pascal P值 | 0.09 |
| Sherlock P值 | 0.199 |
| 胎儿β | 0.059 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GLB1 | CHR3 | 33093482 | G | 一个 | NM_000404 NM_001079811 NM_001135602 |
。 。 。 |
沉默的 沉默的 沉默的 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23081079 | 3 | 33138872 | GLB1 | 1.92E-9 | -0.012 | 1.61E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TGIF2 | 0.91 | 0.75 |
| itprip | 0.90 | 0.66 |
| lipg | 0.90 | 0.52 |
| CELSR1 | 0.90 | 0.46 |
| Notch1 | 0.89 | 0.83 |
| TP53 | 0.89 | 0.70 |
| PTBP1 | 0.89 | 0.81 |
| SFRP1 | 0.88 | 0.62 |
| CDK2 | 0.87 | 0.59 |
| tead2 | 0.87 | 0.46 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ADAP1 | -0.34 | -0.29 |
| C5orf53 | -0.34 | -0.38 |
| FXYD7 | -0.33 | -0.30 |
| RAMP3 | -0.33 | -0.24 |
| LGI1 | -0.32 | -0.24 |
| CKMT1B | -0.32 | -0.23 |
| asphd1 | -0.31 | -0.23 |
| CMTM8 | -0.31 | -0.25 |
| NPM2 | -0.31 | -0.29 |
| SLC9A3R2 | -0.31 | -0.06 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
| 去：0004565 | β-半乳糖苷酶活性 | 塔斯 | 3143362 | |
| 去：0016798 | 水解酶活性，作用于糖基键 | IEA | - | |
| GO：0043169 | 阳离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005975 | 碳水化合物代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005764 | 溶酶体 | IEA | - | |
| 去：0009341 | β-半乳糖苷酶复合物 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg银乳糖代谢 | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg其他聚糖降解 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg糖胺聚糖降解 | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg鞘脂代谢 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg糖果果脂生物合成系列系列 | 15 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome糖磷脂代谢 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HS堵嘴降解 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Keratan硫酸角质角蛋白代谢 | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组硫酸葡萄糖降解 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome硫酸乙酰肝素肝素HS GAG代谢 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome糖胺聚糖代谢 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组鞘脂代谢 | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heidenblad Amplicon 12P11 12 DN | 30 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasaki成人T细胞白血病 | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan V2晚分化基因 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布鲁诺造血 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheng由雌二醇印记 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |