基因页：AHDC1
概括？
| 基因 | 27245 |
| 象征 | AHDC1 |
| 同义词 | MRD25 |
| 描述 | 钩DNA结合基序包含1个 |
| 参考 | MIM：615790|HGNC：HGNC：25230|ENSEMBL：ENSG00000126705|HPRD：10885|Vega：Otthumg00000003398 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p36.13 |
| Pascal P值 | 0.482 |
| Sherlock P值 | 0.746 |
| 胎儿β | -0.069 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
| DNM：Guipponi_2014 | 整个外显子组测序分析 | 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AHDC1 | CHR1 | 27876044 | G | 一个 | NM_001029882 | 。 | 沉默的 | 精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 | ||
| AHDC1 | C | t | NM_001029882 | P.R487W | 错过 | 0 | 0.99 | 精神分裂症 | DNM：Guipponi_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG22421699 | 1 | 28261367 | AHDC1 | 1.556E-4 | 5.579 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6733654 | CHR2 | 1963270 | AHDC1 | 27245 | 0.16 | 反式 | ||
| RS7595584 | CHR2 | 175652187 | AHDC1 | 27245 | 0.05 | 反式 | ||
| RS11073378 | CHR15 | 95227876 | AHDC1 | 27245 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN | 88 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN | 84 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dirmeier LMP1响应迟到 | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染8小时DN | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线响应集群D6 | 37 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPI1和FLI1 DN的Juban目标 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |