概括
基因 27246
象征 RNF115
同义词 BCA2 | ZNF364
描述 环手指蛋白115
参考 HGNC:HGNC:18154|HPRD:18328|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21.1
Sherlock P值 0.809
胎儿β -0.444
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 RNF115 27246 3.013E-4 反式
RS16955618 CHR15 29937543 RNF115 27246 0 反式
RS6032295 CHR20 44178138 RNF115 27246 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号cor dn 36 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-151 286 292 M8 HSA-MIR-151 Acuagacugaagcucuugagg
mir-377 231 237 1a HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu