基因页：PCDH17

概括？
基因 27253
象征 PCDH17
同义词 PCDH68 | PCH68
描述 原钙粘蛋白17
参考 MIM：611760|HGNC：HGNC：14267|Ensembl：ENSG00000118946|Vega：Otthumg0000000016992
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q21.1
Pascal P值 0.378
Sherlock P值 0.555
胎儿β 0.513
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG26444528 13 58207859 PCDH17 2.969E-4 -0.529 0.039 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007155 细胞粘附 IEA -
去：0007156 同粒细胞粘附 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗伊伤口血管向上 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP靶向 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应灰色DN 74 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr的Takeda目标 85 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙槽横纹肌肉瘤 98 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标30分钟 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 589 596 1A，M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-124/506 2016 2022 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-141/200a 2752 2758 1a HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-15/16/195/424/497 105 111 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-182 2939 2945 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-203.1 545 551 M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-217 499 505 1a HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-219 309 315 M8 HSA-MIR-219脑 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-224 388 394 1a HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-24 1049 1055 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-29 1940年 1946年 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-3p 1323 1329 M8 HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-30-5p 998 1005 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-339 84 90 1a HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-376 1174 1180 M8 HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-378 922 928 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-378* 505 511 1a HSA-MIR-422B cuggacuuggagagaaggcc
HSA-MIR-422A cuggacuagggucagaaggcc
mir-379 1261 1268 1A，M8 HSA-MIR-379脑 UgguagacuauggaaCGUA
mir-383 352 359 1A，M8 HSA-MIR-383脑 agaucagaaggugauuguggcu
mir-495 3606 3613 1A，M8 HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-496 673 679 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-504 423 430 1A，M8 HSA-MIR-504 agacccugucugcacucuau
mir-542-3p 2733 2739 M8 HSA-MIR-542-3P ugugacauugauaacugaaa
mir-96 2939 2945 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc
HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc