基因页：CNTN6

概括？
基因 27255
象征 CNTN6
同义词 NB3
描述 Contactin 6
参考 MIM：607220|HGNC：HGNC：2176|ENSEMBL：ENSG00000134115|HPRD：06242|Vega：Otthumg00000119030
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P26.3
Pascal P值 0.111
胎儿β -1.278
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞粘附和透射信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10962070 Chr9 15566016 CNTN6 27255 0.16 反式
RS4741528 Chr9 15655977 CNTN6 27255 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0005524 ATP结合 IEA -
GO：0016887 ATPase活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007417 中枢神经系统发展 塔斯 大脑（GO期限：6） 9486763
去：0007155 细胞粘附 塔斯 9486763
去：0007219 Notch信号通路 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005886 质膜 IEA -
GO：0031225 锚定在膜上 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID Notch途径 59 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani病毒GPCR信号向上 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu IL4信号传导 94 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因