基因页：LSM1
Summary？
| GeneID | 27257 |
| 象征 | LSM1 |
| 同义词 | CASM | YJL124C |
| 描述 | LSM1同源物，mRNA降解相关 |
| 参考 | MIM：607281|HGNC：HGNC：20472|ENSEMBL：ENSG00000175324|HPRD：06281|Vega：Otthumg00000164051 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8p11.2 |
| Pascal P值 | 1.673E-5 |
| Sherlock P值 | 0.204 |
| 胎儿β | 0.033 |
| DMG | 1（＃研究） |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与sc有关hizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb. | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23409476 | 8 | 38034180 | LSM1 | 1.71E-8 | -0.009 | 6.22E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| C3ORF60 | 2P1 |DKFZP564J0123 |E3-3 |MGC10527 | 染色体3开放阅读框60 | Two-hybrid | Biogrid | 15231747 |
| Clic1 | G6 |NCC27 | 氯化物内通道1 | Two-hybrid | Biogrid | 14667819 |
| exosc6 | EAP4 |mtr3 |mtr3p |HMTR3P |P11 | 外泌体组件6 | Two-hybrid | Biogrid | 15231747 |
| exosc8 | CIP3 |EAP2 |OIP2 |RP11-421P11.3 |RRP43 |RRP43P |BA421P11.3 |P9 | 外泌体组件8 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| Grhpr | glxr |glyd |PH2 | 乙酰乙酸还原酶/羟基丙酮酸还原酶 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| HSP90AA1 | FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | 热休克蛋白90KDAα（胞质），A类成员1 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| LSM2 | C6orf28 |g7b |YBL026W |snrnp | LSM2同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11920408|15231747 |
| LSM3 | smx4 |USS2 |YLR438C | LSM3同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| LSM4 | yer112w | LSM4同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11920408 |
| LSM5 | FLJ12710 |yer146w | LSM5同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| LSM6 | YDR378C | LSM6同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| LSM7 | YNL147W | LSM7同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| N4BP1 | FLJ31821 |KIAA0615 |MGC176730 | NEDD4结合蛋白1 | Two-hybrid | Biogrid | 15231747 |
| 纳尔 | ASNRS |NARS1 | 天冬酰基-TRNA合成酶 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| PSMB5 | LMPX |MB1 |MGC104214 |X | 蛋白酶体（Prosome，宏观）亚基，β类型，5 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| PSMB8 | D6S216 |D6S216E |LMP7 |MGC1491 |PSMB5I |ring10 |beta5i | 蛋白酶体（Prosome，大型）亚基，Beta类型，8（大型多功能肽酶7） | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| ptprc | B220 |CD45 |CD45R |GP180 |LCA |ly5 |T200 | 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体类型，C | - | HPRD | 8980254 |
| SMN1 | BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 | 运动神经元1，端粒的生存 | - | HPRD | 10851237 |
| TMEM214 | FLJ20254 |FLJ39682 | 跨膜蛋白214 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| UPF2 | DKFZP434D222 |hupf2 |KIAA1408 |MGC138834 |MGC138835 |出租2 |SMG-3 | UPF2胡说转录本同源物（酵母）的调节剂 | Two-hybrid | Biogrid | 15231747 |
| uxt | ART-27 | 普遍表达的转录本 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| VPS11 | end1 |pep5 |RNF108 |HVPS11 | 液泡蛋白排序11个同源物（S. cerevisiae） | Two-hybrid | Biogrid | 15231747 |