基因页：Amph
Summary？
| GeneID | 273 |
| Symbol | Amph |
| 同义词 | AMPH1 |
| 描述 | 两亲动 |
| 参考 | MIM：600418|HGNC:HGNC:471|Ensembl：ENSG00000078053|HPRD：02687|Vega：Otthumg0000000023725 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7P14-P13 |
| Pascal P值 | 0.25 |
| Sherlock P值 | 0.345 |
| 胎儿β | -0.743 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 胞吞作用 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN G2Cdb.human_Synaptosome CompositeSet Darnell FMRP目标 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| Literature | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 4 | |
| 网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献：0.252 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7132043 | CHR12 | 80968399 | Amph | 273 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触transmission | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 9182667 |
| GO：0048488 | 突触囊泡内吞作用 | IEA | 轴突，突触，神经递质（GO术语级别：7） | - |
| 去：0007612 | 学习 | IEA | - | |
| 去：0006897 | 内吞作用 | 塔斯 | 9182667 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008021 | 突触囊泡 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：12） | - |
| 去：0008021 | 突触囊泡 | 塔斯 | 突触，神经递质（GO期限：12） | 1628617 |
| GO：0045202 | synapse | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
| GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
| 去:0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | 塔斯 | 9182667 | |
| GO：0030054 | cell junction | IEA | - | |
| GO:0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AP1B1 | ADTB1 |AP105A |BAM22 |clapb2 | 与Adaptor相关的蛋白质复合物1，β1亚基 | 重构的复合物 | Biogrid | 9280305 |
| AP2A2 | adtab |clapa2 |hip9 |催眠 | 与Adaptor相关的蛋白质复合物2，Alpha 2亚基 | 重构的复合物 | Biogrid | 9280305 |
| Bin1 | amph2 |amphl |DKFZP547F068 |MGC10367 |SH3P9 | bridging integrator 1 | - | HPRD，Biogrid | 9348539 |
| 机舱1 | CAIN | KIAA0330 | PPP3IN | 钙调蛋白结合蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 10931822 |
| CDK5R1 | CDK5P35 |CDK5R |MGC33831 |NCK5A |p23 |P25 |p35 |p35nck5a | 细胞周期蛋白依赖性激酶5，调节亚基1（p35） | Amphiphysin 1与p35相互作用。这种相互作用是在人两亲蛋白1和大鼠p35之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 11113134 |
| CDK5R1 | CDK5P35 |CDK5R |MGC33831 |NCK5A |p23 |P25 |p35 |p35nck5a | 细胞周期蛋白依赖性激酶5，调节亚基1（p35） | - | HPRD，Biogrid | 11113134 |
| cltc | CHC |CHC17 |CLH-17 |cltcl2 |HC |KIAA0034 | 网状蛋白，重链（HC） | - | HPRD | 9195986|9280305 |9603201 |
| cltc | CHC |CHC17 |CLH-17 |cltcl2 |HC |KIAA0034 | 网状蛋白，重链（HC） | 体外 体内 重构的复合物 |
Biogrid | 9195986|9603201 |
| DNM1 | DNM | Dynamin 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9148966|9280305 |9341169|9348539 |11877424 |
| DNM1 | DNM | Dynamin 1 | - | HPRD | 9148966|9348539 |9694653|11877424 | 10899172 |
| PLD1 | - | 磷脂酶D1，磷脂酰胆碱特异性 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 表型抑制 重构的复合物 |
Biogrid | 10764771 |
| PLD2 | - | phospholipase D2 | - | HPRD，Biogrid | 10764771 |
| PTK2 | Fadk |fak |fak1 |pp125fak | PTK2蛋白酪氨酸激酶2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12558988 |
| SH3GL2 | CNSA2 |een-b1 |FLJ20276 |FLJ25015 |SH3D2A |SH3P4 | SH3-domain GRB2-like 2 | 重构的复合物 | Biogrid | 9341169|12456676 |
| SH3GL2 | CNSA2 |een-b1 |FLJ20276 |FLJ25015 |SH3D2A |SH3P4 | SH3-domain GRB2-like 2 | - | HPRD | 9315708 |
| SH3GLB1 | BIF-1 |CGI-61 |KIAA0491 |DJ612B15.2 | SH3-domain GRB2-like endophilin B1 | - | HPRD，Biogrid | 12456676 |
| SYN1 | Syn1a |SYN1B |Syni | 突触i | - | HPRD，Biogrid | 10899172 |
| synj1 | Inpp5g | Synaptojanin 1 | - | HPRD | 10542231|14704270 |
| synj1 | Inpp5g | Synaptojanin 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9341169 |
| VTN | V75 |vn |vnt | 玻霉素 | - | HPRD，Biogrid | 12565847 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| miRNA family | 目标位置 | microrna的ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-1/206 | 1073 | 1079 | 1a | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
| hsa-miR-206SZ | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
| HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
| miR-153 | 977 | 983 | 1a | HSA-MIR-153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| mir-26 | 259 | 265 | M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir-28 | 947 | 953 | M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |
| mir-330 | 231 | 237 | M8 | hsa - mir - 330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-448 | 977 | 983 | 1a | hsa-miR-448 | uugcauauguaggauguccccau |