基因页：GCLM
概括？
| 基因 | 2730 |
| 象征 | GCLM |
| 同义词 | Glclr |
| 描述 | 谷氨酸 - 半胱氨酸连接酶修饰剂亚基 |
| 参考 | MIM：601176|HGNC：HGNC：4312|Ensembl：ENSG00000023909|HPRD：03106|Vega：Otthumg0000000010562 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p22.1 |
| Pascal P值 | 0.399 |
| 胎儿β | -0.787 |
| 主持人 | 小脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：6 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1997108 | CHR3 | 109786660 | GCLM | 2730 | 0.06 | 反式 | ||
| RS8071763 | CHR17 | 67930673 | GCLM | 2730 | 0.01 | 反式 | ||
| RS871948 | Chrx | 39342814 | GCLM | 2730 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| glud1 | 0.95 | 0.95 |
| suclg2 | 0.87 | 0.85 |
| GPC5 | 0.85 | 0.85 |
| ITM2C | 0.85 | 0.85 |
| GJA1 | 0.85 | 0.83 |
| add3 | 0.84 | 0.88 |
| PLSCR4 | 0.83 | 0.87 |
| hadhb | 0.83 | 0.83 |
| NT5E | 0.82 | 0.84 |
| rab31 | 0.82 | 0.81 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RTF1 | -0.54 | -0.55 |
| CCAR1 | -0.52 | -0.58 |
| RP9 | -0.52 | -0.59 |
| KIAA1949 | -0.52 | -0.39 |
| mpp3 | -0.51 | -0.46 |
| ZNF821 | -0.51 | -0.47 |
| C18orf22 | -0.51 | -0.47 |
| Gmip | -0.51 | -0.43 |
| AC011491.1 | -0.50 | -0.56 |
| DPF1 | -0.50 | -0.46 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004357 | 谷氨酸 - 半胱氨酸连接酶活性 | 艾达 | 谷氨酸（GO期限：6） | 9841880 |
| 去：0004357 | 谷氨酸 - 半胱氨酸连接酶活性 | 小鬼 | 谷氨酸（GO期限：6） | 16183645 |
| GO：0035226 | 谷氨酸 - 半胱氨酸连接酶催化亚基结合 | IPI | 谷氨酸（GO期限：5） | 9675072|9841880 |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
| GO：0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
| GO：0046982 | 蛋白质异二聚化活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006536 | 谷氨酸代谢过程 | 艾达 | 谷氨酸（GO期限：8） | 9841880|9895302 |
| GO：0035229 | 谷氨酸 - 半胱氨酸连接酶活性的阳性调节 | IEA | 谷氨酸（GO期限：7） | - |
| 去：0006534 | 半胱氨酸代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0006750 | 谷胱甘肽生物合成过程 | 艾达 | 10395918 | |
| 去：0006750 | 谷胱甘肽生物合成过程 | 小鬼 | 12081989 | |
| 去：0006979 | 对氧化应激的反应 | 艾达 | 10395918 | |
| 去：0043066 | 凋亡的负调节 | IEA | - | |
| GO：0042493 | 对药物的反应 | 艾达 | 9895302 | |
| GO：0050880 | 血管大小的调节 | 小鬼 | 12975258 | |
| 去：0051900 | 线粒体去极化的调节 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0017109 | 谷氨酸 - 半胱氨酸连接酶复合物 | IEA | 谷氨酸（GO期限：8） | - |
| 去：0005829 | 细胞质 | nas | 9895302 | |
| 去：0005625 | 可溶性部分 | 艾达 | 9675072 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg谷胱甘肽代谢 | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组硫氨基酸代谢 | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome谷胱甘肽结合 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome II期结合 | 70 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Puiffe入侵被腹水抑制 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gargalovic对氧化磷脂的反应黄色 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 | 79 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1急性LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高 | 147 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌 | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| liang造血细胞数量小vs巨大 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Houstis Ros | 36 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rhodes未分化的癌症 | 69 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng对砷的反应 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gerhold脂肪形成 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Singh NFE2L2目标 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 | 125 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G1 DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ghandhi旁观者辐照 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-25/32/92/363/367 | 249 | 255 | 1a | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
| HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
| HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
| HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
| HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||