基因页:Bhlhe22
概括?
基因 | 27319 |
象征 | Bhlhe22 |
同义词 | bhlhb5 | beta3 | cagl85 | tnrc20 |
描述 | 基本的螺旋环螺旋家庭成员E22 |
参考 | MIM:613483|HGNC:HGNC:11963|ENSEMBL:ENSG00000180828|HPRD:16551|Vega:Otthumg00000164386 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q13 |
Pascal P值 | 0.008 |
胎儿β | 3.38 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21008602 | 8 | 65492936 | Bhlhe22 | 4.267E-4 | -0.46 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
CG15740363 | 8 | 65488839 | Bhlhe22 | 5.14e-8 | -0.016 | 1.36E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BHLHE22_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016564 | 转录阻遏活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KHSV miRNAS DN的Samols目标 | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dawson TCL1中的甲基化 | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
staege ewing家庭肿瘤 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-136 | 1473 | 1479年 | M8 | HSA-MIR-136 | Acuccauuuuuuugaugaugaugga |
mir-137 | 1145 | 1151 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-18 | 729 | 735 | M8 | HSA-MIR-18A | uaagguggaugugcagaua |
HSA-MIR-18B | uaaggugcaucuagugcagua | ||||
mir-182 | 924 | 930 | M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-192/215 | 1604 | 1611 | 1A,M8 | HSA-MIR-192 | cugaccuaugaauugacagcc |
HSA-MIR-215 | Augaccuaugaauugacagac | ||||
mir-320 | 1026 | 1032 | 1a | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
mir-376 | 603 | 609 | 1a | HSA-MIR-376A | aucauagaaaaauccacgu |
HSA-MIR-376B | aucauagaaaaauccauguu | ||||
mir-377 | 1310 | 1316 | 1a | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
mir-378* | 1045 | 1051 | 1a | HSA-MIR-422B | cuggacuuggagagaaggcc |
HSA-MIR-422A | cuggacuagggucagaaggcc | ||||
mir-381 | 613 | 619 | M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
mir-486 | 1056 | 1062 | 1a | HSA-MIR-486 | uccuguacugagcugcccccgag |
mir-493-5p | 1242 | 1248 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
mir-495 | 1321 | 1327 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |