概括
基因 27319
象征 Bhlhe22
同义词 bhlhb5 | beta3 | cagl85 | tnrc20
描述 基本的螺旋环螺旋家庭成员E22
参考 MIM:613483|HGNC:HGNC:11963|ENSEMBL:ENSG00000180828|HPRD:16551|Vega:Otthumg00000164386
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q13
Pascal P值 0.008
胎儿β 3.38
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21008602 8 65492936 Bhlhe22 4.267E-4 -0.46 0.045 DMG:Wockner_2014
CG15740363 8 65488839 Bhlhe22 5.14e-8 -0.016 1.36E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016564 转录阻遏活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KHSV miRNAS DN的Samols目标 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dawson TCL1中的甲基化 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
staege ewing家庭肿瘤 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-136 1473 1479年 M8 HSA-MIR-136 Acuccauuuuuuugaugaugaugga
mir-137 1145 1151 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-18 729 735 M8 HSA-MIR-18A uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18B uaaggugcaucuagugcagua
mir-182 924 930 M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-192/215 1604 1611 1A,M8 HSA-MIR-192 cugaccuaugaauugacagcc
HSA-MIR-215 Augaccuaugaauugacagac
mir-320 1026 1032 1a HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-376 603 609 1a HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-377 1310 1316 1a HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-378* 1045 1051 1a HSA-MIR-422B cuggacuuggagagaaggcc
HSA-MIR-422A cuggacuagggucagaaggcc
mir-381 613 619 M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-486 1056 1062 1a HSA-MIR-486 uccuguacugagcugcccccgag
mir-493-5p 1242 1248 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-495 1321 1327 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu