基因页面:HTATSF1
总结吗?
| GeneID | 27336年 |
| 象征 | HTATSF1 |
| 同义词 | TAT-SF1 | TATSF1 | dJ196E23.2 |
| 描述 | hiv - 1答具体因素1 |
| 参考 | MIM: 300346|HGNC: HGNC: 5276|运用:ENSG00000102241|HPRD: 02282|织女:OTTHUMG00000022510 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | Xq26.3 |
| 夏洛克假定值 | 0.364 |
| 胎儿β | 0.383 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0526 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HTATSF1 | chrX | 135581821 | G | 一个 | NM_001163280 NM_014500 |
p.84S > N p.84S > N |
错义 错义 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7132043 | chr12 | 80968399 | HTATSF1 | 27336年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003676 | 核酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003702 | RNA聚合酶II转录因子的活动 | 助教 | 10454543 | |
| 去:0003711 | 转录延伸监管活动 | 助教 | 10454543 | |
| 去:0003723 | 核糖核酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006357 | 监管RNA聚合酶II启动子的转录 | 助教 | 10454543 | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0019079 | 病毒基因组复制 | 助教 | 10454543 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 助教 | 10454543 | |
| 去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 图姆收缩期心力衰竭 | 423年 | 283年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺未分化癌 | 722年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 转换CDC25 CHIARADONNA肿瘤 | 120年 | 73年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN血清剥夺了细胞凋亡 | 552年 | 347年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过小道HAMAI细胞凋亡 | 584年 | 356年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHETH肝癌VS TXNIP PAM4损失 | 261年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 考夫曼DNA复制的基因 | 147年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHEOK应对巯嘌呤和LD MTX | 10 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究人类MITODB 6 2002 | 429年 | 260年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究线粒体 | 447年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足 | 43 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋化性了 | 74年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-141/200a | 70年 | 76年 | 1 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
| mir - 194 | 72年 | 78年 | 1 | hsa - mir - 194 | UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA |
| mir - 495 | 236年 | 242年 | 1 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |