基因页面:民意调查
总结吗?
GeneID | 27343年 |
象征 | 民意调查 |
同义词 | BETAN | POLKAPPA |
描述 | 聚合酶(DNA)λ |
参考 | MIM: 606343|HGNC: HGNC: 9184|运用:ENSG00000166169|HPRD: 09394|织女:OTTHUMG00000018933 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 10 q23处 |
帕斯卡假定值 | 0.006 |
夏洛克假定值 | 0.902 |
胎儿β | 0.337 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
民意调查 | chr10 | 103347017 | C | T | NM_001174084 NM_001174085 NM_013274 NR_033406 |
p.34G > E p.34G > E p.34G > E 。 |
错义 错义 错义 intronic |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg03173714 | 10 | 103341227 | 民意调查 | 1.524的军医 | -0.378 | 0.032 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs11217775 | chr11 | 120121322 | 民意调查 | 27343年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/POLL_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG基地切除修复 | 35 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG非同源末端连接 | 14 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID DNA PK通路 | 16 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
考夫曼DNA修复基因 | 230年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
考夫曼DNA复制的基因 | 147年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
年级结肠和直肠癌DN | 56 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
西方肾上腺皮质肿瘤DN | 546年 | 362年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |