基因页:STK39
概括?
基因 | 27347 |
象征 | STK39 |
同义词 | dcht | pask | spak |
描述 | 丝氨酸/苏氨酸激酶39 |
参考 | MIM:607648|HGNC:HGNC:17717|ENSEMBL:ENSG00000198648|HPRD:09627|Vega:Otthumg00000133745 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q24.3 |
Pascal P值 | 0.391 |
Sherlock P值 | 0.797 |
胎儿β | -1.216 |
支持 | G2CDB.HUMANNRC g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02395 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/STK39_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0004702 | 受体信号蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | nas | 10980603 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | nas | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | nas | 10980603 | |
去:0006950 | 对压力的反应 | nas | 10980603 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | nas | 10980603 | |
去:0005737 | 细胞质 | nas | 10980603 | |
GO:0016323 | 基底外侧质膜 | IEA | - | |
GO:0016324 | 顶质膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID TCR途径 | 66 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN | 74 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer Pthlh靶向 | 112 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML分割与正常静止 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 | 137 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边溃疡性结肠炎与癌症 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dawson TCL1中的甲基化 | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Mycn扩增靶向 | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim生发中心T助手 | 66 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森对雄激素的反应 | 86 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 | 67 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线低剂量DN | 67 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化DN沉默 | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Finetti乳腺癌Kinome Blue | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Takeer吉西他滨抗性DN | 122 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟C | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir1靶标dn | 7 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir30目标dn | 27 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 1393 | 1399年 | 1a | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-124/506 | 777 | 783 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-128 | 534 | 540 | 1a | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
mir-150 | 764 | 771 | 1A,M8 | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
mir-19 | 1464 | 1470 | 1a | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
mir-22 | 1269 | 1275 | M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
mir-223 | 529 | 535 | M8 | HSA-MIR-223 | ugucuuugucaauacccc |
mir-25/32/92/363/367 | 1081 | 1087 | M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
mir-26 | 1030 | 1037 | 1A,M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc | ||||
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
mir-27 | 534 | 541 | 1A,M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
mir-30-5p | 1406 | 1413 | 1A,M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-34b | 447 | 453 | M8 | HSA-MIR-34B | uaggcagugucauagcugauug |