概括
基因 2735
象征 Gli1
同义词 GLI
描述 GLI家庭锌指1
参考 MIM:165220|HGNC:HGNC:4317|ENSEMBL:ENSG00000111087|HPRD:01311|Vega:Otthumg00000167332
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q13.3
Pascal P值 0.024

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Mertk 0.91 0.87
ACSBG1 0.90 0.91
dio2 0.89 0.85
SLC13A5 0.89 0.83
plekho2 0.88 0.72
赫夫 0.88 0.82
PPP1R3C 0.88 0.84
aldh4a1 0.87 0.89
GPR37L1 0.87 0.88
SLC1A3 0.86 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Med19 -0.60 -0.71
DUSP12 -0.58 -0.71
CWF19L1 -0.57 -0.65
TAF11 -0.57 -0.66
RTF1 -0.57 -0.70
PAK1IP1 -0.57 -0.68
PHF14 -0.56 -0.71
ZNF329 -0.56 -0.64
mllt11 -0.56 -0.63
NOP56 -0.56 -0.63

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg刺猬信号通路 56 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG基底细胞癌 55 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta SHH途径 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID刺猬Gli途径 48 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进度DN 100 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH目标 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和Sufu的Lee目标 53 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应11 103 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 134 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Madan DPPA4目标 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因