概括
基因 2743
象征 Glrb
同义词 hkpx2
描述 甘氨酸受体β
参考 MIM:138492|HGNC:HGNC:4329|ENSEMBL:ENSG00000109738|HPRD:11751|Vega:Otthumg00000161954
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q31.3
Pascal P值 0.328
Sherlock P值 0.959
胎儿β -1.865
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:5

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10120856 4 157996959 Glrb 2.863E-4 0.382 0.039 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TPP1 0.90 0.93
C5orf4 0.88 0.87
CDH20 0.87 0.86
IGSF11 0.86 0.86
galntl2 0.86 0.82
GPRC5B 0.85 0.83
PADI2 0.85 0.84
WIPF1 0.85 0.90
KCNJ10 0.85 0.90
ATP10B 0.85 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NR2C2AP -0.57 -0.59
AIM2 -0.56 -0.62
KIAA1949 -0.54 -0.45
STMN1 -0.53 -0.51
Med19 -0.53 -0.56
ZNF300 -0.53 -0.43
tubb2b -0.53 -0.50
RBMX2 -0.53 -0.61
CCDC28B -0.53 -0.60
ZNF821 -0.52 -0.45

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0030594 神经递质受体活性 IEA 神经递质(GO期限:5) -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 11929858|15215304
去:0005216 离子通道活动 IEA -
去:0005230 细胞外配体门控离子通道活性 IEA -
GO:0016934 细胞外基因门控氯化物通道活性 艾达 8717357
GO:0016594 甘氨酸结合 小鬼 15748848
GO:0031404 氯离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007268 突触传输 小鬼 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) 11929858
去:0007218 神经肽信号通路 艾达 神经递质(GO期限:8) 8717357
去:0007399 神经系统的发展 小鬼 神经突(GO期限:5) 11929858
去:0001964 惊吓反应 小鬼 11929858
去:0006821 氯化物运输 IEA -
去:0006811 离子运输 艾达 8717357
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 nas 8717357
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome离子通道传输 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome配体门控离子通道传输 21 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对雌二醇的反应 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tseng成脂潜力 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝脏DN中的Smid乳腺癌复发 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔内B 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇0的时间反应0 76 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 797 804 1A,M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-135 404 410 M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-18 139 146 1A,M8 HSA-MIR-18A uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18B uaaggugcaucuagugcagua
mir-203.1 33 39 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-369-3p 435 441 M8 HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu