基因页:glud1
Summary?
GeneID | 2746 |
Symbol | glud1 |
同义词 | gdh | gdh1 | glud |
描述 | 谷氨酸脱氢酶1 |
参考 | MIM:138130|HGNC:HGNC:4335|Ensembl:ENSG00000148672|HPRD:11748|Vega:Otthumg0000000018666 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q23.3 |
Pascal P值 | 0.514 |
Sherlock P值 | 0.684 |
胎儿β | -1.44 |
主持人 | 小脑 海马 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP CompositeSet |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 4 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GLUD1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004353 | 谷氨酸脱氢酶[NAD(P)+]活性 | EXP | 谷氨酸(GO期限:6) | 429360 |
去:0004353 | 谷氨酸脱氢酶[NAD(P)+]活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:6) | - |
去:0004352 | 谷氨酸脱氢酶活性 | 艾达 | 谷氨酸(GO期限:6) | 15578726 |
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006538 | 谷氨酸分解代谢过程 | 艾达 | 谷氨酸(GO期限:9) | 6121377 |
去:0007169 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 | nas | 15609325 | |
去:0006520 | 氨基酸代谢过程 | IEA | - | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005739 | 线粒体 | 艾达 | 15578726 | |
去:0005759 | 线粒体基质 | EXP | 429360 | |
去:0005759 | 线粒体基质 | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-103/107 | 558 | 564 | M8 | hsa-miR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
hsa-miR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
miR-15/16/195/424/497 | 559 | 565 | M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu |