基因页:GMPR
Summary?
基因ID | 2766 |
象征 | GMPR |
同义词 | GMPR 1 | GMPR1 |
描述 | 鸟苷单磷酸还原酶 |
参考 | MIM:139265|HGNC:HGNC:4376|Ensembl:ENSG00000137198|HPRD:00754|Vega:Otthumg0000000014302 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p23 |
Pascal P值 | 0.018 |
Sherlock P值 | 0.762 |
胎儿β | -1.163 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0159 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG19001871 | 6 | 16238672 | GMPR | 7.25e-9 | -0.029 | 3.62E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10497012 | CHR2 | 148319726 | GMPR | 2766 | 0.16 | 反式 | ||
RS1981925 | CHR4 | 34348578 | GMPR | 2766 | 0.09 | 反式 | ||
RS12663450 | CHR6 | 38135729 | GMPR | 2766 | 0.18 | 反式 | ||
RS4909503 | CHR8 | 136671520 | GMPR | 2766 | 0.13 | 反式 | ||
RS10958899 | Chr9 | 10128700 | GMPR | 2766 | 0.05 | 反式 | ||
RS10958907 | Chr9 | 10131580 | GMPR | 2766 | 0.05 | 反式 | ||
RS1322159 | Chr9 | 10132695 | GMPR | 2766 | 0.06 | 反式 | ||
RS10958910 | Chr9 | 10134759 | GMPR | 2766 | 0.04 | 反式 | ||
RS16958826 | CHR16 | 82925548 | GMPR | 2766 | 0.13 | 反式 | ||
RS11080561 | CHR18 | 12257229 | GMPR | 2766 | 1.045e-4 | 反式 | ||
RS7268640 | CHR20 | 47150267 | GMPR | 2766 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GMPR_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LRWD1 | 0.93 | 0.94 |
MRPS2 | 0.93 | 0.92 |
GPR172A | 0.93 | 0.94 |
WDR54 | 0.92 | 0.93 |
PTOV1 | 0.92 | 0.93 |
pold2 | 0.91 | 0.93 |
EMD | 0.91 | 0.92 |
WDR18 | 0.91 | 0.92 |
ZNF408 | 0.91 | 0.92 |
TARBP2 | 0.91 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.72 | -0.82 |
AF347015.33 | -0.71 | -0.81 |
MT-CO2 | -0.71 | -0.79 |
AF347015.8 | -0.70 | -0.80 |
AF347015.31 | -0.70 | -0.78 |
mt-cyb | -0.68 | -0.79 |
AF347015.15 | -0.67 | -0.78 |
AF347015.2 | -0.66 | -0.80 |
AF347015.26 | -0.65 | -0.79 |
C5orf53 | -0.63 | -0.68 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003920 | GMP还原酶活性 | 塔斯 | 9813009 | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
去:0030955 | 钾离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009117 | 核苷酸代谢过程 | IEA | - | |
去:0009409 | 对寒冷的反应 | 塔斯 | 9813009 | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Purine代谢 | 159 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
核苷酸的反应组代谢 | 72 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome嘌呤挽救 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组嘌呤代谢 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤区域 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn alpha响应 | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素的反应 | 203 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗干扰素反应性基因 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部 | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlingemann皮肤致癌TPA DN | 29 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 8小时 | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ehlers非整倍性dn | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗马胰岛素的目标MUSCLE UP | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹间皮瘤生存 | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔内成熟 | 116 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |