Summary
基因ID 2766
象征 GMPR
同义词 GMPR 1 | GMPR1
描述 鸟苷单磷酸还原酶
参考 MIM:139265|HGNC:HGNC:4376|Ensembl:ENSG00000137198|HPRD:00754|Vega:Otthumg0000000014302
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p23
Pascal P值 0.018
Sherlock P值 0.762
胎儿β -1.163
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0159
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG19001871 6 16238672 GMPR 7.25e-9 -0.029 3.62E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10497012 CHR2 148319726 GMPR 2766 0.16 反式
RS1981925 CHR4 34348578 GMPR 2766 0.09 反式
RS12663450 CHR6 38135729 GMPR 2766 0.18 反式
RS4909503 CHR8 136671520 GMPR 2766 0.13 反式
RS10958899 Chr9 10128700 GMPR 2766 0.05 反式
RS10958907 Chr9 10131580 GMPR 2766 0.05 反式
RS1322159 Chr9 10132695 GMPR 2766 0.06 反式
RS10958910 Chr9 10134759 GMPR 2766 0.04 反式
RS16958826 CHR16 82925548 GMPR 2766 0.13 反式
RS11080561 CHR18 12257229 GMPR 2766 1.045e-4 反式
RS7268640 CHR20 47150267 GMPR 2766 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LRWD1 0.93 0.94
MRPS2 0.93 0.92
GPR172A 0.93 0.94
WDR54 0.92 0.93
PTOV1 0.92 0.93
pold2 0.91 0.93
EMD 0.91 0.92
WDR18 0.91 0.92
ZNF408 0.91 0.92
TARBP2 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.72 -0.82
AF347015.33 -0.71 -0.81
MT-CO2 -0.71 -0.79
AF347015.8 -0.70 -0.80
AF347015.31 -0.70 -0.78
mt-cyb -0.68 -0.79
AF347015.15 -0.67 -0.78
AF347015.2 -0.66 -0.80
AF347015.26 -0.65 -0.79
C5orf53 -0.63 -0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003920 GMP还原酶活性 塔斯 9813009
GO:0016491 氧化还原酶活性 IEA -
去:0030955 钾离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009117 核苷酸代谢过程 IEA -
去:0009409 对寒冷的反应 塔斯 9813009
GO:0055114 还原氧化 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
核苷酸的反应组代谢 72 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome嘌呤挽救 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组嘌呤代谢 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 182 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤区域 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn alpha响应 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗干扰素反应性基因 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlingemann皮肤致癌TPA DN 29 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 8小时 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ehlers非整倍性dn 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗马胰岛素的目标MUSCLE UP 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹间皮瘤生存 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 134 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟 116 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因